Фашистам удалось при содействии одного предателя узнать местонахождение Минского подпольного обкома и центра, координирующего боевую работу партизан. Гитлеровскими отрядами были заняты окружающие деревни, блокированы дороги. Специального отряда по охране подпольного партийного и боевого центра в то время еще не было, при обкоме находилась лишь небольшая группа вооруженных людей. К тому же многие товарищи отсутствовали: были на боевых заданиях, на связях с районами, отрядами и партизанскими группами. Положение становилось критическим. Кольцо блокады сжималось. Одна из эсэсовских групп подобралась к самому лагерю. Ночью бойцы Василия Ивановича смелым налетом уничтожили эту группу. На другой день на дальнюю разведку пошел Алексей Бондарь с тремя бойцами. В стычке с большой эсэсовской группой он был тяжело ранен в ногу. Наступившая ночь и болотные дебри помогли ему спастись.
Необходимо было прорываться через блокаду, искать другое место. Решили пробиваться через деревню, где эсэсовцев было сравнительно мало. На окраине этой деревни был мелиоративный канал — обычная канава с водой. Она проходила и у лагеря, а за деревней — у самого леса. Ночью, погрузившись на лодки (в одной из них был раненый товарищ Бондарь), поплыли мимо деревни к лесу. Роман Мачульский с небольшой группой бойцов подошел к деревне, где были эсэсовцы, и завязал с ними бой. Те в панике разбежались. Лодки проплыли мимо деревни и благополучно достигли леса.
Еще находясь вблизи озера, во вражеском окружении, Василий Иванович направил связного в отряд Меркуля за помощью. Но связной, товарищ Петренко, не добрался до отряда: героически погиб в неравном бою с эсэсовцами.
Перед началом новых крупных операций осенью 1941 года обком перебазировался поближе к железной и шоссейной дорогам, в лесной Любанский район на остров Зыслов, глухое место среди лесов и болот. Тут же находилась база одного из партизанских отрядов. На этом острове встретили и 24–ю годовщину Октябрьской революции, коллективно слушали радиопередачу о торжественном собрании в Москве.
Впервые люди встречали такой знаменательный день вдали от родных и близких, в суровой обстановке партизанских будней.
Прослушав радиопередачу, многие товарищи сразу лее ушли на боевые операции. Во всех районах партизаны ознаменовали славную годовщину боевыми делами: разгромили крупный гитлеровский гарнизон в районном центре Любань, взорвали нефтебазы, нанесли сокрушительные удары по гитлеровским гарнизонам в таких крупных населенных пунктах, как Погост, Смиловичи, Копыль, Слуцк, и многих других. В Минске подпольщики организовали крупные диверсии на железнодорожном узле, разрушили водокачку, что осложнило водоснабжение вражеского транспорта. На многих крупнейших станциях и перегонах были взорваны и пущены под откос гитлеровские эшелоны с живой силой и боевой техникой, уничтожено много паровозов.
В эти октябрьские дни еще выше поднялась уверенность населения в силах партизан и подпольных центров. Ряды партизан пополнились новыми тысячами бойцов.
Подпольный обком возглавил всю боевую работу партизанских отрядов, создал соединение партизан области. Обязанности между членами обкома были распределены так: Василий Иванович Козлов возглавлял руководство партийной организации и боевыми действиями соединения области; Р. Н. Мачульский был его помощником по боевым операциям и организации новых отрядов; А. Г. Бондарь возглавил разведку и контрразведку, И. Д. Варвашеня — агитационную и пропагандистскую работу, И. А. Вельский — организационно–партийную работу в первичных организациях и боевых отрядах.
Многие вопросы приходилось решать подпольному обкому и его руководителю Василию Ивановичу. В первые месяцы организации подполья и партизанской борьбы встречались так называемые дикие отряды, не признававшие никакого руководства и дисциплины. Некоторые из них кочевали с места на место и часто занимались мародерством и попойками. Иногда появлялись и такие люди, которые, прикрывшись почетным званием партизана, не прочь были подальше обойти суровые тяготы войны, пореже встречаться с врагом, жить по принципу «Хоть день, да мой!». Встречались и просто растерявшиеся в суровой обстановке люди, утратившие волю к борьбе. Тут кроме недостаточной сознательности иногда сказывалось и разлагающее влияние вражеской агентуры, в отдельных случаях проникавшей в партизанскую среду.
Обком партии и лично Василий Иванович помимо воспитательной работы вынуждены были вести и беспощадную борьбу с мародерами, предателями, вражескими лазутчиками.