Все это волновало Бондаренко. Он понимал, что наступит момент, когда немцы начнут широкое наступление на Брянский лес. «Нет, в одиночку бороться нельзя» — подвел итог своим мыслям Алексей Дмитриевич. Он пишет письмо секретарю соседнего Выгонического райкома партии Фильковскому: «Дорогие друзья! Мы узнали о ваших замечательных боевых делах… Пора нам объединиться. Эта задача стала теперь первоочередной. Партийным организациям нужен единый руководящий центр, а отрядам — единое командование. Обсудите этот вопрос и дайте свои соображения. Обнимаю вас всех и крепко целую. Ваш А. Бондаренко».
Выгонические товарищи ответили: «Мы за объединение отрядов и за централизованное руководство партийными организациями. Ты член обкома — тебе и карты в руки. Берись за это дело, рассчитывая на нашу полную поддержку».
Орловский обком партии и Военный совет Брянского фронта положительно отнеслись к объединению партизанских отрядов и приказом от 23 апреля 1942 года назначили командующим объединенными отрядами юго–западных районов Орловской области Д. В. Емлютина, комиссаром — секретаря Трубчевского райкома партии А. Д. Бондаренко, начальником штаба — капитана В. К. Гоголюка. Вместе с приказом пришло из центра и сообщение о том, что скоро в расположение партизанского лагеря прилетит самолет. Эта радостная весть быстро облетела отряд. Налаживалась постоянная связь с Большой землей — значит, будут боеприпасы, продукты, письма от родных, свежие газеты.
Краснозвездный самолет приземлился на лесном аэродроме ночью. Первую воздушную трассу к партизанам Брянщины проложил летчик Владимир Ярошевич из гвардейского полка майора Трутаева. Алексей Дмитриевич крепко пожал руку летчика, поздравил его с первым рейсом на Малую землю и горячо благодарил за газеты.
— Это же наше оружие, не менее эффективное, чем автоматы и пулеметы.
После коллективных читок в отряде номера газет переправлялись в город и села. Люди теперь были в курсе всех событий на фронте и в тылу.
С той памятной ночи связь с обкомом партии и Военным советом фронта стала регулярной. Во второй половине мая Бондаренко запросил Большую землю, чтобы отряду дали разрешение провести операцию на железной дороге в районе Брянск — Гомель. Эта магистраль давно привлекала партизан. Приказ был получен. На коротком совещании командиров пяти партизанских отрядов Трубчевского и Выгоничского районов комиссар разъяснил цели операции: «Если дорога будет бездействовать хотя бы два дня, то это значит, что к фашистским войскам на фронте не подойдут десятки эшелонов с танками, артиллерией, солдатами. Пушки и танки на передовой не получат боеприпасов и горючего.
Дорога охраняется. Коммунисты и комсомольцы должны показать пример бесстрашия и мужества».
В ночь на 22 мая в упорном бою партизаны овладели в нескольких местах одновременно железнодорожным полотном… Разрушены пути, перерезана телеграфная и телефонная связь. На пятнадцать суток вывели партизаны из строя этот важный участок дороги.
Военный совет Брянского фронта дал высокую оценку проведенной операции.
В конце августа 1942 года большая группа командного состава партизанских отрядов Брянщины и Украины вылетела в Москву на прием к руководителям партии и правительства. Об их отъезде пронюхала вражеская разведка. Гитлеровское командование посчитало этот момент удобным, чтобы раз и навсегда покончить с партизанами. К массиву Брянских лесов были стянуты части разных родов войск: и гренадерские полки, и артиллерийские дивизионы, танковый и саперный батальоны — в общей сложности до 50 тысяч боевых единиц.
В этих сложных условиях Бондаренко провел конференцию представителей брянских, украинских, белорусских и курских партизанских отрядов. Участники конференции подготовили общий план боевых действий.
На следующий день газета «Партизанская правда», которая стала выходить по инициативе комиссара Бондаренко, сообщила о конференции населению Брянщины. Гитлеровцы, чтобы окружить партизанские отряды, сняли некоторые части с Брянского и Воронежского направлений.
В штабе объединенных отрядов представляли всю сложность создавшейся обстановки. Уточнялись детали плана, проверялась связь между отрядами, проводились собрания бойцов. Даже ночью в землянке комиссара многолюдно — тут командный и политический состав и связные отрядов и бригад, которые, получив распоряжение, мелькнут на пороге землянки и тут же растворятся в темноте леса.
Скоро Брянский лес наполнился воем снарядов, лязгом танков, трескотней автоматных и пулеметных очередей, ревом минометов. А над лесом, словно коршуны, кружились вражеские самолеты. Такого еще не видывал Брянский лес…
Партизаны вступили в смертельную схватку с врагом. Комиссара Бондаренко всегда можно было видеть там, где решалась судьба боя.