Наибольшего успеха Сюше добился в следующей войне – против Пруссии. Кампания 1806 г. началась ожесточенной схваткой у Заальфельда. Головная дивизия корпуса Ланна, ведомая Сюше, попала под плотный ружейно-орудийный огонь пруссаков, как только сошла с гор. Огневой вал врага не выбил из колеи генерала. Он приказал стремительно атаковать противника, несмотря на то что войска следовавшего за Ланном Ожеро отстали и не успевали поддержать соплеменников. Все утро шел ожесточенный бой, и только во втором часу дня французы начали одолевать пруссаков. В отчаянной попытке остановить усиливающееся смятение в своих рядах молодой и амбициозный прусский принц Людвиг
Накануне битвы у Йены именно дивизия Сюше захватила важные высоты Ландграфенберг и закрепилась там. Вечером перед сражением Наполеон прибыл в расположение дивизии Сюше и всю ночь общался с генералом, обсуждая перспективы предстоящей схватки. На следующий день солдаты Сюше открыли сражение, наступая на острие главного удара корпуса Ланна. Неся тяжелые потери под артиллерийским шквалом противника, Сюше овладел-таки стратегически важной деревней Клозвиц, хладнокровно отражая все вражеские контратаки своей превосходной легкой кавалерией, сумел захватить 22 вражеских орудия. После сражения, когда мимо генерала вели прусских пленных, старый офицер, весь израненный и помнивший еще триумфы Фридриха Великого, обратился к Сюше с горьким вопросом: «Господин генерал, мы разбиты так же, как австрийцы при Аустерлице?» Вопрос остался без ответа.
В Польской кампании 1807 г. Сюше по-прежнему действовал в корпусе маршала Ланна. В сражении при Пултуске он продемонстрировал все качества блестящего дивизионного командира, ведя неравный бой с превосходящими силами русских. Весь день его войска ожесточенно бились за Пултуск, однако русские, обладая численным превосходством, сумели не только удержать город, но и заставить французов отступить на те позиции, с которых они пошли в бой. Даже отступая, Сюше столь умело контр атаковал, что русским постоянно приходилось вводить в дело резервы, чтобы отражать французов.
Уже тогда Луи Габриэль Сюше показал всем, чего он стоит как самостоятельный военачальник. Однако служба в корпусе блистательного Ланна оставляла генералу очень мало надежд на получение маршальского жезла. Для этого следовало обязательно выйти из-под подчинения корпусного начальника, через голову которого подняться выше было невозможно. Очень скоро судьба улыбнется Сюше: он получит новое назначение – на самостоятельное руководство крупным войсковым соединением. Но это будет потом…