После смерти Жана Гастона титул великого герцога Тосканского перешел, по соглашению, Францу Стефану Лотарингскому. Но все имущество Медичи, движимое и недвижимое, пока еще оставалось во владении Анны Марии Луизы. Во Флоренцию прибыл представитель Франца Стефана принц Краонский, Анна Мария Луиза выслала ему навстречу эскорт вооруженных стражников и роскошную карету с кучером и грумами, запряженную дюжиной отборных лошадей из конюшен дворца Питти. Принц предложил ей регентство над Великим герцогством Тосканским, но она гордо отказалась. Последние годы жизни курфюрстина жила одна в специально отведенном для нее крыле палаццо Питти. Принцесса имела право приглашать гостей, которых она принимала в зале для аудиенций под серебряным балдахином, одетая во все черное. Теперь она носила траур не только по мужу, но и по угасшей династии. Кроме нее в этом крыле жили только ее верные слуги и воспоминания.
Анна Мария Луиза выходила редко, только иногда можно было увидеть проезжающую по улицам Флоренции карету, в глубине которой находилась курфюрстина. Она много времени посвящала реорганизации огромной коллекции произведений искусства, которую собирали ее предки в течение трех столетий. К этой коллекции относилось и имущество династии делла Ровере, которое привезла во Флоренцию ее бабушка Виктория. Туда же курфюрстина добавила свои собственные сокровища: драгоценности, украшения, картины, фигурки из жемчуга, мебель, китайский и японский фарфор, редкие наутилусы.
Анна Мария Луиза была умная и дальновидная женщина. Она прекрасно знала, что у герцога Лотарингского были большие долги. И понимала, что как только имущество Медичи попадет к нему в руки – он продаст многие ценные произведения искусства, и они исчезнут из Флоренции навсегда. Осядут в частных коллекциях или пропадут неизвестно куда. Принцесса не хотела, чтобы Флоренцию постигла судьба Феррары, Урбино, Мантуи или Пармы. Эти города были буквально опустошены из-за вымирания или переезда их правящих династий. Поэтому 31 октября 1737 года она заключила с Габсбургами так называемый Семейный пакт, благодаря которому не позволила Флоренции потерять свое наследие. Этим документом было установлено, что: «Все культурное наследие и важные коллекции, ранее принадлежавшие семье Медичи, навсегда связаны с городом Флоренцией. Запрещается вывозить за пределы столицы и государства Великого герцогства галереи, картины, статуи, библиотеки, драгоценности и прочие ценности из наследства Светлейшего Великого Герцога, чтобы они остались для украшения государства, для полезности публики и привлечения любопытства иностранцев». Семейный пакт был заключен и подписан с двух сторон в Вене, куда сама Анна Мария Луиза поехать не могла из-за возраста и состояния здоровья. Вместо себя она отправила своего представителя, посла герцогства Тосканского в Вене маркиза Фердинанда Бартоломео, который подписал этот документ за нее.
В январе 1739 года Франц Стефан Лотарингский с женой Марией Терезией Австрийской приехали во Флоренцию. В честь их приезда была построена монументальная триумфальная арка, которая до сих пор сохранилась на современной площади Свободы. Она расположена перед остатками ворот защитной стены столицы герцогства Тосканского. Перед тем как въехать в город, супруги проезжали через эту арку. Монумент украшен пластическим декором, состоящим из шестнадцати аллегорических фигур, фризом с геральдическими мотивами, рельефами с оружейными трофеями, четырьмя барельефами с «Эпизодами из жизни Франца Стефана Лотарингского» и двумя двуглавыми орлами – символом империи Габсбургов. Наверху арки находится конная статуя Франца Стефана в окружении двух аллегорий Побед, или аллегорий Славы.
Супруги проехали на карете через арку и ворота, потом по центральной улице до собора Санта-Мария дель Фьоре. В храме они остановились, чтобы прослушать торжественную мессу в честь их приезда. Затем проследовали через площадь Синьории и Старый мост ко дворцу Питти. Всюду собиралась толпа флорентийцев, встречая своего нового великого герцога аплодисментами, барабанной дробью и звуками фанфар. Во дворце их принимала курфюрстина Анна Мария Луиза Медичи, которой Франц еще раз предложил регентство Великого герцогства от своего имени. Но вновь услышал отказ.