В 1939 году Королева перевели с Колымы в «шарашку» к А.Н. Туполеву, бывшему руководителю дипломного проекта еще студента Королева. А через несколько лет он уже в звании подполковника собирал остатки немецких ФАУ в поверженной Германии. Но самое «забавное» в истории с СП. Королевым вот что. Арестован он был по доносу своих сослуживцев летом 1938 года. По легенде, представленной в кино, почти сразу попадает на Колыму. Мама Королева долго и упорно добивается его освобождения, и в кинофильме показана сцена ее прихода к знаменитой летчице B.C. Гризодубовой, которая говорит, что теперь, когда в НКВД назначен Берия, вопрос об освобождении Сергея Павловича будет решен положительно.
И действительно, именно назначение 25 ноября 1938 году главой НКВД Л.П. Берии помогает Королеву вернуться в Москву. Правда, осенью 1938 года Королев как-то мистически не успевает попасть на последний корабль с Колымы до Магадана, который тонет вместе со всеми перевозимыми заключенными и вольными. Зиму живет чуть не в порту, долго болеет, но выздоравливает. И только к лету 1939 года приезжает в Москву Но его сразу не освобождают, и он еще пару лет сидит в «шараге» у А.Н. Туполева. И, похоже, что его просто прятали как, уже тогда основного специалиста по ракетной технике, будущего главного конструктора. (Кстати, о Туполеве. Уже во многих книгах о «безвинно пострадавшем от сталинского произвола» замечательном конструкторе самолета АНТ-25, перелетевшем в Америку через Северный полюс, АН. Туполеве рассказано, что его посадили после командировки в США, в которой он должен был выбрать и закупить образцы самолетов для последующего их выпуска в СССР по лицензии. Туполев мало того что закупил не очень нужные для России самолеты (растрата государственных средств в особо крупных размерах), но и, мол, документацию на них привез в дюймовой системе измерения (хотя, вообще-то, другой в США и не бывает.)Но при закупке какого-нибудь «товара» за границей покупатель из СССР всегда сталкивался с одной интересной особенностью западного рынка. К примеру, в СССР все авиационные КБ хоть и конкурировали между собой за получение госсредств, но все равно сидели на зарплате, и даже если оставались без «заказа», то с голоду не умирали и зарплату свою получали. Хотя их могли и просто разогнать, закрыв КБ, но работников все равно пристраивали в другие КБ.
На Западе между частными фирмами идет жесткая борьба за заказы и за выживание. И благополучие фирмы целиком зависит от того, насколько удачно она пристроит свой самолет. И когда появляется на горизонте богатый покупатель — а Туполев представлял огромную страну и огромные деньги, приобретая самолеты в Штатах, — фирмы готовы были пойти на любые «презенты», лишь бы только всучить свой товар, свою машину Ведь прошло всего несколько лет после страшной Великой депрессии, при которой люди в Америке буквально с голоду загибались, сидя без заказов и без работы. Так что, скорее всего АН. Туполев еще и на взятках погорел. Все биографы Андрея Николаевича отмечали его слабость к некоторому барству. Но до сих пор никто не торопится опубликовывать протоколы допросов и обвинений против «жертв репрессий» и протоколы допросов на АН. Туполева. А ведь другие в «шарашках» не сидели вообще.)
К сожалению, с Королевым произошла одна путаница. Отсутствие еще недавно доступного издания «Журналов посещения» кабинета Сталина с квалифицированными комментариями привело к тому, что во вполне приличной книге С. Кремлева «Берия. Лучший менеджер XX века» была допущена ошибка. В книге указано, что еще 15 октября 1938 года в кабинете у Сталина в течение полутора часов находился Королев. Из-за того что в «Журналах посещений» не всегда указывались инициалы посетителей, то С. Кремлев сделал вывод, что этот Королев и есть будущий Главный конструктор, Сергей Павлович. Однако в вышедшем только в августе 2008 года полном варианте «Журнала посещений» указано в пояснениях, что в кабинете у Сталина находился Королев Г. Н., один из руководителей авиационной промышленности. Затем этот Г.Н. Королев был у Сталина в кабинете 3 апреля 1939 года с 18.00 до 18.35.
В апреле на Севере еще не открывают морское сообщение, и будущий Главный конструктор СП. Королев в апреле 1939 года действительно продолжал находиться на этой самой Колыме. Так что вся эта страшная история про то, как он шел пешком чуть не сто километров по тайге в мороз до порта, чтобы успеть на последний пароход, про оставленный кем-то хлеб у какого-то колодца, который спас его от голодной смерти, про утонувший этот пароход, на котором Королеву не хватило места, и про страшную болезнь, от которой Сергей Павлович чуть не умер в этом порту, отлежавшись у какой-то старушки, показанная в фильме, снятом по воспоминаниям самого Сергея Павловича, которые он оставил своим друзьям и родным, вполне правдива.