Американские радиолюбители продолжали работать, хотя их DX-активность была в значительной степени снижена. Американский радиолюбительский журнал Radio News даже анонсировал свои первые ежегодные международные DX-соревнования в 1939 году, словно ничего дурного в мире не произошло. И только в июне 1940 года американским радиолюбителям запретили проводить радиосвязи с радиостанциями из района военных действий, а после воздушного налета Японии на Пирл-Харбор (7 декабря 1941 года) вся радиолюбительская работа в эфире была в США полностью приостановлена. Одиночным американским радиолюбителям позволялось излучать в эфир в течение всей войны, если они были членами Военной аварийной радиослужбы (War Emergency Radio Service), но обычные любительские радиосвязи уже не проводились. Буквально перед своим воздушным налетом на Пирл-Харбор японское правительство полностью запретило все частные радиосвязи, и велела своим радиолюбителям прекратить работу в эфире.
Советские радиолюбители продолжали работать в эфире, но практически только внутри СССР.
В марте 1940 года были проведены первые Всесоюзные женские соревнования, посвященные Международному женскому дню. Победителями стали операторы коллективной радиостанции Московского института инженеров связи UK3AH (Мариам Бассина, Зоя Чиркова и Александра Гусева).
В 1940 году проходят первые всесоюзные соревнования по скоростной радиотелеграфии. Первое место среди мужчин занял москвич С. Мещеряков (прием: буквы – 180, цифры – 120; передача: буквы – 162, цифры – 95 зн/мин). Среди женщин – А. Белокрылина из Горького (прием: буквы – 160, цифры – 100; передача: буквы – 150, цифры – 80 зн/мин).
3 ноября 1940 года были проведены очередные всесоюзные соревнования коротковолновиков. Эти соревнования примечательны тем, что впервые в них принимали участие коротковолновики их новых советских республик – эстонцы Мери (ES9E) и Андерсон (ES4G).
22 июня 1941 года Германия напала на СССР, и советским гражданам было предписано сдать все свои радиоприемники и тем более радиопередатчики в компетентные советские органы. Понятно, что ни о какой радиолюбительской активности советских радиолюбителей теперь не могло быть и речи. Тысячи советских коротковолновики ушли на фронт или сражались с нацистами в подполье. Большинство из них стали военными радистами или связистами. Один из организаторов радиосвязи в военные годы, генерал-майор войск связи в отставке В. Иванов позже писал: "Радиолюбители-коротковолновики в годы Великой Отечественной войны на фронте, как правило, были лучшими связистами. Их воинское мастерство, находчивость и смелость высоко ценились военным командованием. Когда на фронт прибывало новое пополнение связистов, мы прежде всего интересовались: есть ли среди них радиолюбители? Ведь именно радиолюбители быстро осваивали боевые радиостанции, им доверялось обеспечение самых ответственных связей и, надо сказать, что они оправдывали это доверие".
Много коротковолновиков и из других стран сражалось на фронтах второй мировой войны (как с одной, так и с другой стороны фронта). Их высокая квалификация была востребована почти повсеместно. Например, перед вступлением в мировую войну Соединенных Штатов, было 60 тысяч лицензированных американских радиолюбителей. Среди них примерно 25 тысяч пошли служить в вооруженные силы, 25 тысяч других помогали военной промышленности или включались в штат военных школ в качестве инструкторов.
К январю 1945 года стало ясно, что Германия проиграла войну и, что вскоре наступит мир и свобода. В это время небольшой американский издатель взял на себя смелость опубликовать новый радиолюбительский журнал, получивший название CQ. В начале первым намерением журнала CQ, снабженного подзаголовком "The Radio Amateur's Journal" ("Радиолюбительский журнал"), было содействие передвижной (мобильной) любительской радиосвязи. Со временем журнал расширил свой интерес на полупроводники, пакетную радиосвязь, спутники и другие радиолюбительские темы. Сегодня журнал CQ является главным "конкурентом" журнала QST и учредителем нескольких крупнейших международных соревнований по радиосвязи, среди которых, например, самый престижный CQ World-Wide DX Contest имеет в России статус Кубка мира.
В мае 1945 года война окончилась в Европе, а в августе-сентябре 1945 года в Азии и во всем мире, и радиолюбители с нетерпением стали ждать снятия запрета на работу в эфире.
В 1945 году в Соединенных Штатах развернулась ожесточенная борьба за радиочастотный спектр 44-108 МГц между любительской службой, радиовещанием и телевидением. Радиолюбители потеряли свой 5-метровый диапазон (56-60 МГц), получив взамен новый 6-метровый диапазон (50-54 МГц). Первый канал телевидения стал занимать полосу 44-50 МГц, а второй канал – полосу 54-60 МГц. FM-радиовещание перешло с полосы 44-50 МГц на полосу 88-108 МГц. Кроме того вместо диапазона 2,5 метра (112-116 МГц) вводился новый радиолюбительский диапазон 2 метра (144-148 МГц).