В послевоенный период в Новоиерусалимском монастыре были проведены большие восстановительные работы. В Трапезной и некоторых других помещениях снова разместились музейные экспонаты. К северо-востоку от монастырского ансамбля открылся филиал Московского областного краеведческого музея – архитектурно-этнографический музей под открытом небом – усадьбы крестьян, амбары, бани, другие постройки, а также сельские церкви. При создании музейного комплекса в закрытом монастыре помнили, что всегда сюда, кроме экскурсантов и туристов, приезжали и приезжают многочисленные богомольцы – паломники, которые творят здесь молитвы, совершают круглый год очищающие омовения водой монастырского святого источника (расположенного в 100 м к западу от монастыря) или погружения в р. Иордан (переименованная патриархом Никоном р. Истра).
В 1994 г. Воскресенский Новоиерусалимский монастырь возродился как религиозный центр. Воскресенский Новоиерусалимский монастырь в наши дни имеет подворье в г. Санкт-Петербурге – это храм Воскресения Христова (ул. Камская, д. 11, строение «А»).
В наши дни Воскресенский Новоиерусалимский монастырь прежде всего является значимым религиозным центром, который своей историей и современной жизнью утверждает, упрочивает концепцию «Москва – Третий Рим».
В Воскресенском Новоиерусалимском монастыре пребывают возвращенные из музея мощи святой мученицы Татианы, а по воскресеньям совершается молебен в ее память. Татиана была дочерью богатого и знатного римлянина – тайного христианина. Она воспитывалась по христианским правилам, стала диакониссой, подверглась жестоким мукам за христианскую веру и была убита мечом в Риме. Святая мученица Татиана почитается как покровительница российских студентов.
Приезжающие в Воскресенский Новоиерусалимский монастырь обычно стремятся испить воды из безымянного источника, почитаемого святым. Когда вели строительные работы в подземной церкви монастыря в честь Константина и Елены, вдруг забил этот источник. Над родником возвели небольшой сруб и назвали «Святой колодец». Из него в Гефсиманский сад была отведена труба, вода из которой льется мощной струей у основания Сионского склона.
Кроме большой духовно-религиозной значимости, Воскресенский Новоиерусалимский монастырь остается выдающимся архитектурно-художественным комплексом.
Соборный храм в честь Воскресения Христова (Воскресенский храм, 1658–1685 гг.) является композиционным центром архитектурного ансамбля монастыря, кирпичный собор был задуман как копия иерусалимского храма. По типу, размеру, декоративно-керамическому убранству он не имеет аналогов. Собор представляет собой сложный многообъемный комплекс сооружений. В его состав входят одноглавый крестчатый трехсветный храм Воскресения Христова, грандиозная ротонда с часовней Гроба Господня (первоначально она была перекрыта каменным шатром, который в 1723 г. рухнул, вместо него во второй половине ХVIII в. возвели деревянный шатер, он сгорел в пожаре 1941 г.), заглубленная в землю четырехстолпная церковь Константина и Елены. До 1941 г. была и семиярусная колокольня, но ее взорвали фашисты. Полихромная керамика активно использовалась для украшения этого соборного комплекса. Изразцы изготовляли известные в России мастера тех лет: Степан Полубес, Игнатий Максимов под руководством белорусского мастера Петра Заборского. Рухнувший в 1723 г. каменный шатер ротонды заставил при восстановлении соборного комплекса частично изменить его художественные формы. В восстановлении этого комплекса участвовали известные зодчие И.Ф. Мичурин (1740-е гг.), К.И. Бланк (1750-е – начало 1760-х гг.) и др. По проекту В.В. Растрелли с поправками К.И. Бланка возвели (1756–1761 гг.) вместо каменного деревянный шатер над ротондой (она сгорела в 1941 г.). Интерьер собора был выполнен по проекту В.В. Растрелли. В создании и украшении собора принимали участие М.Ф. Казаков (на рубеже ХVIII – ХIХ вв. он работал над отделкой двух его приделов) и А.Н. Воронихин. Соборный комплекс в честь Воскресения Христова не имеет себе равных, он сыграл исключительную роль в истории русской архитектуры. Соборный комплекс очень сильно пострадал от рук фашистов в 1941 г., восстановительные и реставрационные работы в нем продолжаются с 1950-х гг.
Трапезные палаты с церковью Рождества Христова (1686–1692 гг.) были построены на вклад сестры царя Алексея Михайловича – царевны Татьяны Михайловны Романовой. Это кирпичное здание на высоком подклете с белокаменным убранством в стиле московского барокко. Композиционным центром здания является церковь во имя Рождества Христова в виде двухсветного одноглавого четверика.
Кирпичные больничные палаты (1698 г.) в конце ХVIII в. были перестроены, в них устроили жилье, затем их надстроили, и тогда их стали называть дворцом. Реставрация 1962 г. в основном вернула постройке ее первоначальный облик.
Настоятельские покои (1750 г.) построены на каменных складах (кладовых) 1650-х гг. Помещения покоев связаны анфиладной планировкой. Реставрация 1960-х гг. в основном вернула зданию его первоначальный вид.