Из боевых кораблей первым погиб «Эбер»: после того как он повредил винт, его участь была решена, поскольку без работы машины удержаться в такой ураган на якорях было практически невозможно. «Эбер» несколько раз ударило о рифы, и около половины шестого утра он перевернулся и затонул. С него чудом спаслись лишь лейтенант и четыре матроса. Когда наступил рассвет, то очевидцы увидели, что весь берег усыпан обломками торговых судов и трупами погибших людей. Около 7 часов утра пришла очередь «Нипсика». Ураган сорвал трубу, она упала и пробила палубу. Поскольку корабль быстро терял возможность двигаться, командир принял решение выбросить его на берег, что ему и удалось. «Нипсик» сел на песчаную мель напротив американского консульства. От корабля на берег был протянут спасательный линь, по которому почти весь экипаж, кроме семи погибших, перебрался на берег.
В 8 часов утра произошла катастрофа с «Адлером». Видя, что якоря не держат и корабль неумолимо приближается к рифам, командир Фритце обрубил якорные цепи и решил проскочить через рифы в лагуну, которая была за ними, на попутной океанской волне. Для такого смелого и почти фантастического маневра требовался точнейший расчет и везение, а также самое главное – уверенное владение маневрами корабля. Но этого как раз у командира и не было: маневры корабля почти целиком определял ураган. В итоге «Адлер» был выброшен на плоскую часть рифа и опрокинулся на левый берег. 20 человек были смыты за борт и погибли. Однако, лежа на рифе, «Адлер» оказался в относительной безопасности. Его команда либо спустилась на риф и нашла защиту за корпусом, либо осталась внутри корабля. Многие были ранены. Германский консул Кнаппе, рискуя жизнью, дважды пытался подать спасательный линь на «Адлер». Ему помогали самоанцы, те самые, в которых совсем недавно стреляли немецкие моряки. Наконец, с «Адлера» на берег добрался один офицер и сообщил, что на корабле осталось еще более 60 членов экипажа. Смелые самоанцы бросились в бушующее море и протянули линь к «Адлеру». Однако вскоре он оборвался, и морякам пришлось весь день и всю следующую ночь пробыть на опрокинутом корабле в 400 м от берега.
Положение «Каллиопы» в 8 часов утра стало угрожающим: лопнула левая якорная цепь, и корабль с величайшим трудом удерживался на месте на одном правом якоре. Дрейфующая на якорях и с работающей машиной «Вандалия» быстро надвигалась на «Каллиопу», а затем навалилась на нее. Если бы «Каллиопа» продолжала и дальше стоять на якоре, то «Вандалия», которую ураган бил о носовую часть «Каллиопы», неизбежно потонула бы, получив пробоины от таких ударов. Чтобы предотвратить потопление «Вандалии», командир «Каллиопы» дал задний ход, и «Вандалию» понесло дальше в сторону рифа. Однако в тот момент, когда корабли уже совсем, казалось бы, разошлись, в левый борт «Каллиопы» ударилась «Ольга», также дрейфовавшая на якорях. От столкновения оба судна получили повреждения. Кроме того, «Каллиопа» отклонилась в сторону и сцепилась такелажем с проносимой мимо ее правого борта «Вандалией». В этих условиях командир «Каллиопы» принял решение расклепать якорь и попытаться выйти в океан, ибо дальнейшее пребывание в бухте на якоре грозило выбрасыванием на рифы и гибелью. Когда освободившись от «Вандалии», «Каллиопа» находилась всего в нескольких метрах от рифа, командир корабля увидел проход между рифами и направил в него «Каллиопу». В последний момент, когда корабль уже начал осуществлять маневр, на его пути оказался беспомощный «Трентон», который медленно тонул. Совершив виртуозный маневр, командир «Каллиопы» Кейн вывел корабль в океан. Имеющая ряд повреждений корпуса, потерявшая спасательные шлюпки, якоря, цепи, бушприт, «Каллиопа» избежала гибели.
Тем временем в бухте продолжалась трагедия. Командир «Вандалии» Шунмейкер решил посадить корабль на отмель рядом с «Нипсиком». Без четверти одиннадцать корма «Вандалии» врезалась в риф. Через большую пробоину вода хлынула внутрь корпуса. Моряки «Вандалии» тщетно пытались протянуть спасательный линь на берег, но при этом гибли один за другим. Громадная волна смыла капитана Шунмейкера, и он погиб. Оставшиеся в живых моряки забрались на мачты, которые возвышались над водой.
Около 15 часов одна за другой лопнули якорные цепи «Трентона». Его понесло вдоль рифа, а затем он врезался в корпус полузатопленной «Вандалии», снеся две ее мачты из трех. Моряки, находившиеся на мачтах «Вандалии» и упавшие в воду, перебрались на «Трентон». Больше других повезло «Ольге». Корабль дважды столкнулся с «Трентоном», когда его сорвало с якорей и понесло по бухте. Но затем командир «Ольги» дал ход, и корабль, благополучно разминувшись с рифами, сел на песчаную мель в западной части бухты. Там он оставался до конца урагана. Жертв на нем не было.