В феврале 1829 г. сменился главнокомандующий русской армии — им стал Дибич, который старался координировать совместные действия сухопутных сил и флота. Была произведена высадка десанта, после чего он взял на болгарском побережье Сизополь — в этом принимали участие роты Экипажа. Под Бургасом две его роты под началом капитан-лейтенанта Лялина, сменяя друг друга и неся ощутимые потери, отбивали атаки турок. Южнее Сизополя находились батареи, с помощью которых планировалось захватить г. Василико и Агатополь. Эта задача возлагалась на десант, составленный из гвардейских моряков и Камчатского пехотного полка. В конце июля и в августе, доставленные на двух фрегатах и яхте, десантники заняли эти населенные пункты. Также высадка десанта при участии Экипажа произошла у крепостей Инада и Мидии — они были взяты без серьезных потерь. Командир Экипажа Ф.Ф. Беллинсгаузен за успешные действия в войне получил орден Св. Анны 1-й степени, некоторые офицеры — 2-й и 3-й степени, многих ждало внеочередное производство.
Еще до окончания боевых действий Гвардейский экипаж был отправлен в Крым, Севастополь и Бахчисарай, откуда он вернулся в Петербург только в июне 1830 г.
Новым командиром Экипажа стал контр-адмирал Г.С. Шишмарев, при котором продолжались обязательные учебные выходы в Кронштадт, занятия на берегу в составе 2-й пехотной дивизии Гвардейского корпуса, маневры на Балтике, в частности поход в Ревель. Однако мирные будни были непродолжительными: началась Польская кампания 1830–1831 гг.
Несмотря на то, что в 1828 г. Николай I короновался в Варшаве как король Царства Польского, отношения с поляками оставались в целом напряженными. Революционно-освободительный порыв, охвативший Европу, подтолкнул их на выступление. Поводом к нему послужило повеление польской армии готовиться к походу на Бельгию, стремившуюся обрести независимость от голландской короны. В ответ на это поляки подняли мятеж, и сейм объявил Романовых низложенными, назначив главой правительства Чарторыйского.
Уже в феврале 1831 г. русские части вошли в соприкосновение с польскими войсками. В корпус Дибича для проведения инженерных работ, главным образом наведений переправ, было отправлено несколько офицеров Экипажа, затем туда была откомандирована 6-я рота. Некоторые офицеры приняли участие в знаменитом сражении при Остро ленке 14 мая 1831 г., а также в штурме Варшавы 26 августа. Наведение переправы через Вислу осуществляли в том числе и гвардейские моряки.
После возвращения в Петербург их ждало новое испытание — эпидемия холеры, которая косила людей тысячами. Как и остальное население. Гвардейский экипаж понес серьезные людские потери как среди рядовых, так и в офицерском составе. Более того, гвардейским морякам вместе с другими частями гвардии пришлось усмирять население, учинившее в связи с эпидемией беспорядки.
Хроника Экипажа бесстрастно фиксирует изменения, касавшиеся его быта и устройства во всем их многообразии. Например, 9 августа 1831 г. артиллерийская команда трансформировалась в роту. В ее состав входило 4 офицера, 15 унтер-офицеров, 40 бомбардиров, 60 канониров, 1 барабанщик. 7 нестроевых и 3 матроса. Еще ранее, с января, чины Экипажа начинают обучаться фехтованию в школе известного мастера майора Вальвиля. Было решено обучать этому искусству чинов морского ведомства, и первыми из них оказались гвардейские моряки. Из их числа выделили группу нижних чинов, которые на определенный срок командировались к Вальвилю, где они должны были заниматься только фехтованием, а затем возвращались в Экипаж уже в статусе инструкторов. На регулярно проводившихся в школе смотрах именно чины Экипажа часто оказывались среди лучших, за что удостаивались денежных вознаграждений (от 2 до 5 руб.).
В том же году шефом Экипажа стал вел. кн. Константин Николаевич. С 1832 г. л/с состав гвардейских моряков начинает комплектоваться только «выборными» чинами Черноморского и Балтийского экипажей. В 1833 г. чинов Экипажа все чаще можно было видеть на Семеновском плацу: здесь в специально построенном сарае шло обучение стрельбе по методу мастера Гартунга, для чего использовались семилинейные ружья. Здесь же моряки постигали и строевую науку, приобретая «правильную выправку и полноту шага». Занятиями руководили офицеры и нижние чины гвардейских саперов.
В 1835 г. вместо скончавшегося Шишмарева командиром Экипажа становится капитан 1 ранга Н.Г. Казин. В этом году состоялись большие маневры на Балтике и в Финском заливе. Продолжались и учения на берегу: в Кронштадте и окрестностях столицы. Экипаж получил шанцевый инструмент, какой был у гвардейских саперов.
В 1838 г. были введены особые знаки отличия в память о подвигах, совершенных воинскими частями: орденские ленты и скобы к древкам знамен с надписями с указанием даты основания, повода для награды и пр.
На скобе знамени Гвардейского экипажа значилось: «Александр I. Гвардейский экипаж.