Ее история в значительной степени связана с именем М. Л. Банщикова. Банщиков Михаил Лаврентьевич – младший судовой врач «Варяга». После боя награжден орденом Св. Георгия IV степени, медалью «За бой Варяга и Корейца 27 января 1904 г.» (10.04.1904), памятным жетоном белого металла. В 1904 г. назначен в Николаевский морской госпиталь в Кронштадте, где проработал до Октябрской революции. После 1917 г. вышел в отставку в чине капитана 1-го ранга медицинской службы. После 1917 г. – врач больниц Петрограда, в 1930-е гг. – врач поликлиники Октябрьской ж. д. С 1936 г. – врач родильного отделения больницы им. И. Г. Коняшина Московского района города Ленинграда, отличник здравоохранения (1939 г.). В 1941–1945 – главный врач больницы им. И. Г. Коняшина Московского района города Ленинграда, заслуженный врач РСФСР (Указ Президиума Верховного Совета СССР от 15 февраля 1943 г.), с 1944 г. – член ВКП(б), награжден орденом Ленина (Указ Президиума Верховного Совета СССР от 18 мая 1944 г.: «…за самоотверженную работу и выдающиеся заслуги в деле охраны здоровья трудящихся города и бойцов Ленинградского фронта в период войны с немецко-фашистскими захватчиками…»), медалью «За оборону Ленинграда». Умер в 1945 г. Похоронен на Волковском кладбище, могила не сохранилась.
24 мая 1945 г. на базе хирургического отделения больницы образована кафедра факультетской хирургии № 2 Военно-морской медицинской академии (позже название кафедры несколько раз менялось). При основании кафедру возглавил доктор медицинских наук профессор генерал-майор медицинской службы Михаил Семенович Лисицын (1891–1961 гг.). Под его руководством на кафедре изучались проблемы шока, операционной травмы, послеоперационных пневмоний. Основными направлениями научных изысканий 1950–1970 гг. под руководством профессора И. Д. Житнюка (1903–1976) были проблемы лечения ожоговой болезни, отсроченной хирургической обработки ран, профилактики и лечения перитонита, реконструктивных операций на желудке и кишечнике.
В 1970 г. начальником кафедры назначен заслуженный деятель науки РСФСР лауреат Государственных премий и премии Совета Министров СССР доктор медицинских наук профессор генерал-майор медицинской службы Михаил Иванович Лыткин, который руководил кафедрой 7 лет. В этот период развивается углубленное изучение патогенеза и лечения разлитого перитонита, желудочно-кишечных кровотечений, перфоративных язв желудка и двенадцатиперстной кишки, портальной гипертензии. По инициативе профессора Лыткина на базе больницы № 21 им. И. Г. Коняшина организован городской центр по лечению желудочно-кишечных кровотечений.
С 1977 по 1985 г. кафедрой руководил заслуженный деятель науки РФ член-корреспондент РАМН доктор медицинских наук профессор генерал-майор медицинской службы Игорь Александрович Ерюхин. Под его руководством велась серьезная научно-исследовательская работа, а также разрабатывались новые методы лечения.
С 1985 по 1998 г. кафедрой руководил заслуженный деятель науки РФ доктор медицинских наук профессор генерал-майор медицинской службы Анатолий Алексеевич Курыгин, которому в 1987 г. присуждена Государственная премия СССР за разработку и внедрение в клиническую практику новых методов лечения язвы двенадцатиперстной кишки. В этот период сотрудниками кафедры продолжали разрабатываться вопросы неотложной абдоминальной хирургии. За 13 лет руководства профессора А. А. Курыгина на кафедре защищены 13 докторских и 37 кандидатских диссертаций.
В 1998–2002 гг. кафедру возглавлял заслуженный врач РФ доктор медицинских наук профессор полковник медицинской службы Юрий Михайлович Стойко. Под его руководством получили развитие новые направления, связанные с герниологией и патологией кровеносных сосудов. При нем на кафедре были защищены 4 кандидатские диссертации. После увольнения из рядов Вооруженных сил профессор Ю. М. Стойко возглавил хирургическую службу Национального медико-хирургического центра им. Н. И. Пирогова, также является главным хирургом Центрального федерального округа.
С 2002 г. начальником кафедры является заслуженный врач РФ доктор медицинских наук профессор полковник медицинской службы Георгий Иванович Синенченко.
Весь профессорско-преподавательский состав кафедры имеет ученые степени, а более половины – ученые звания. Почетные звания имеют два сотрудника.
Три верхних этажа здания занимает частная стоматологическая поликлиника, а два нижних этажа недавно частично передали Новодевичьему монастырю. И сейчас здесь находится Православный центр Новодевичьего монастыря, где есть воскресная школа, центр помощи безнадзорным детям и православный медико-просветительский центр «Жизнь», еще там есть центр помощи людям с алкогольной зависимостью.
Дом № 106 / Черниговская ул., 8 (исторический адрес: Забалканский пр., 98)