Николаевскую военную богадельню закрыли в 1918 г., богослужения прекратились. Вскоре в соборе был устроен архив НКВД, в 1928 г. наиболее ценные иконы исчезли. Удалось спасти святыню храма – чудотворную Иерусалимскую икону Божией Матери. Позже в храме устроили овощной склад, иконостас уничтожили, из икон большого размера сделали стеллажи. Эти иконы из пророческого и праотеческого рядов, сильно разрушенные, в 1960-е гг. попали в Музей древнерусской культуры и искусства имени Андрея Рублева. Оставшееся внутреннее церковное убранство было вывезено и исчезло бесследно. Корпуса богадельни отдали под жилые квартиры. В ходе реставрации собора, проводившейся в 1980-е гг., предполагалось переоборудовать его в концертный зал. Однако 25 мая 1997 г. в соборе после долгого перерыва был отслужен молебен, Храм восстанавливается. В нем сохранились старинные паникадила, возвращена часть икон из иконостаса. Чудотворный список Иерусалимской иконы Божией Матери, пребывающий в Покровском соборе, был написан во второй половине XVII века мастерами Оружейной палаты. Святыня пребывала в уже упраздненном соборе до 1932 г. Потом она сохранялась в храме Рождества Христова в Измайлове.
Покрова Пресвятой Богородицы в Красном селе церковь
(Нижняя Красносельская улица, дом № 12).Покровский храм с приделом святителя Николая на месте обветшавшей деревянной церкви 1620 г. выстроили в 1701 г. К началу XX в. в нем сохранялись иконы XVI в. В 1730 г. устроили второй, левый придел Усекновения главы Иоанна Предтечи. К 1751 г. выстроили трапезную и колокольню. В 1816 г. было сооружено крестообразное завершение. В 1838 г. по проекту архитектора О.И. Бове вновь возведены пять глав, кресты, шпиль колокольни, установлен новый иконостас. Во время обновления храма в 1902–1904 гг. с восточной стороны были сделаны пристройки к боковым приделам, алтари которых переместили в новые помещения из трапезной, и для них поставили новые иконостасы. С северо-западной стороны к зданию пристроили ризницу. Обновленный храм освятили 25 июля 1904 г. В нем пребывала особо чтимая икона Покрова Пресвятой Богородицы.
В 1933 г. церковь начали ломать. Был уничтожен алтарь, снесены барабаны куполов и колокольня, окна растесали. В церковном здании разместили завод. Богослужения были возобновлены 7 января 1997 г. Построена временная деревянная звонница. В храме находятся чтимые иконы Спасителя, Божией Матери «Троеручица», Иоанна Предтечи.
Покрова Пресвятой Богородицы в Кудрине церковь
(уничтожена).Кудринская площадь, в 1919–1992 гг. называвшаяся площадью Восстания, получила свое историческое название по древнему селу Кудрино, известному с XIV в. После постройки Земляного города окрестности села Кудрино считались городским выгоном и стали довольно быстро застраиваться. К середине XVII века там уже выросла Кудринская слобода. В 1652 г. в ней уже существует деревянная церковь Покрова Пресвятой Богородицы. С 1660 г. при храме известен придел святителя Николая. По сведениям, собранным М.И. Александровским, жители Кудринской слободы 14 сентября 1713 г. получили разрешение построить каменную церковь Покрова Пресвятой Богородицы. Никольский придел освятили 2 октября 1714 г. Далее из-за указа о запрете каменного строительства в Москве работы затянулись. Главный храм был достроен только в 1722 г. Деревянную церковь XVII века продали на вывоз в село Троицкие Сельцы в 1716 г.
Церковь была построена в стиле петровского барокко, отличавшегося простотой и ясностью форм, доходивших почти до аскетизма. О принадлежности к стилю барокко в данном храме напоминало только завершение фасадов люккарнами и высокий двухъярусный барабан купола. В 1800 г. в храме расширили трапезную, в которой устроили придел Алексея, человека Божия, и выстроили новую колокольню. Хотя основным стилем в это время был классицизм, главка над новым приделом была сделана в стиле барокко, чтобы не нарушать стиля всего храма. Колокольня завершалась высоким шпилем. «Если смотреть на нее (Кудринскую площадь) с Поварской, то по оси оказывалась церковь Покрова в Кудрине с колокольней, увенчанной высоким позолоченным шпилем. Интересно и то, что на эту же колокольню была направлена ось и Большой Никитской улицы. Очень удачно в свое время строители церкви поставили ее», – писал в своих воспоминаниях Борис Маркус. Высокое стройное здание церкви красиво сочеталось со стоящим рядом зданием Вдовьего дома. О внутреннем убранстве церкви известно крайне мало. В ней был иконостас середины XVIII века, несколько переделанный в 1830-е гг. Сохранялось несколько образов XVII века из прежней деревянной церкви.
Покровскую церковь закрыли в 1931 г., а снос ее был разрешен Моссоветом 13 мая 1932 г. Полностью храм уничтожили к 1937 г.
Покрова Пресвятой Богородицы в Лёвшине церковь
(уничтожена).