С захватом власти моджахедами в 1992 г. гражданская война не прекратилась, начались бои разных партий джихада. Многие из них, еще находясь в оппозиции, создали свои разведывательные органы. Лучшей разведкой считалась секретная служба партии Хекматиара «Сакхар» («Лучшие слуги Аллаха»), основанная с помощью пакистанской разведки в 1982 г. и занимавшаяся сбором разведданных, диверсиями против советских войск и Царандоя, ликвидацией активистов НДПА на местах. В 1992 г. моджахеды формально создали единое правительство президента Бурханудцина Раббани, Хекматиар стал премьер-министром, а знаменитый «лев Пандшера» Шах-Масуд — министром обороны. Но новые хозяева страны не распускали свои вооруженные отряды, воюя друг с другом, с шиитами, фанатиками «Талибана» и узбеками бывшего наджибовского генерала Дустума. По сути, их спецслужбы, как и у боснийцев, в условиях войны не сумели сформироваться в нечто постоянное и цельное. Хотя при Раббани в 1992–1996 гг. действовала Исламская служба безопасности во главе с Абдулхаком, убитым позднее в боях с талибами, и Военная разведка во главе с генералом Фахимом, костяк которой составили бывшие сотрудники подпольной «Сакхар» и других моджахедских разведок.
Они совершали массовые казни чиновников бывшей ДРА, организовывали диверсии против мятежных узбеков Дустума, пуштунов и талибов, а также поддерживали осевших на севере страны исламских мятежников и террористов таджикской Исламской партии возрождения. Лидеры таджикских боевиков Киеметдин, Нури, братья Садировы укрывались на афганской территории с ведома моджахедов, как и некоторые представители чеченских боевиков, узбеки «Хезба-Тахрири», кашмирские и арабские террористы. Здесь «братьев по вере» обучали сотрудники служб безопасности Раббани и созданный при военной разведке моджахедов спецназ «Аист», возглавляемый диверсантом по кличке «Конфу». Все это продолжалось до 1996 г., пока талибы не выгнали всех старых моджахедов из Кабула и их примирившиеся наконец вожди не засели на севере под прикрытием Пандшера и войска Шах-Масуда.
Талибы во главе с муллой Омаром также пытались создать собственные спецслужбы: военную разведку, Службу безопасности «Талибана» и «Министерство порока и добродетели», исполнявшее роль тайной религиозной полиции. Методы их были столь же жестоки, как и у ХАД или охранки Раббани. Привлекая на свою сторону радикальных исламистов всего мира («Аль-Кайду» Бен Ладена, ХАМАС, кашмирцев, узбеков Джумы Намангани, уйгуров, чеченцев), талибская разведка организовала против «Северного альянса» моджахедов Раббани серию терактов, включая убийство арабскими наемниками из «Аль-Кайды» знаменитого полководца северян Шах-Масуда. Два марокканских араба осенью 2001 г. под видом журналистов проникли в штаб северян в Тол у кане и взорвали Масуда вместе с собой зарядом динамита. После разгрома следующей зимой талибов их спецслужбы разбежались, а руководитель
Службы безопасности Васид попал в плен к правительственным войскам Раббани. Чуть позднее в Кандагаре сдался глава «Министерства порока и добродетели» одноногий мулла Тураби. Командир военной разведки талибов Ахмадулла погиб осенью 2002 г.: американцы разбомбили его кортеж.
«Северный альянс», продолжающий именовать себя правительством Исламского Афганистана, пережил гибель своего харизматического военачальника Масуда. Во главе армии северян встал бывший начальник военной разведки Фахим, а его на этом посту сменил Дауд. Как известно, в 2001 г. «Северный альянс» при помощи американских бомбардировок разбил талибов и вернулся в Кабул. Но начались новые распри между фракциями моджахедов, недобитыми талибами, узбеками, пуштунской вольницей племен, сторонниками Захир-шаха в эмиграции. Конца тридцатилетней бойне пока не видно. Возглавивший правительство после сдачи Раббани полномочий лидер пуштунов Хамид Карзай сразу поставил во главе военной разведки своего пуштунского соратника Гулалая, а командовать гражданским Управлением разведки другого пуштуна — Тахвиди.
В хаосе, которым сопровождалось возвращение к власти старых моджахедов, непрочному временному правительству Карзая не подчинялись ни пуштунская вольница, ни полевые командиры «Северного альянса», ни собственные спецслужбы. В феврале 2002 г. в кабульском аэропорту на глазах тысяч афганцев был убит и выброшен из самолета министр транспорта Рахман: как выяснилось позднее, убили его в ходе ссоры высокопоставленные офицеры новой правительственной армии, в убийстве принимал участие и начальник Управления разведки Тахвиди. Факт безнаказанного убийства члена правительства главой регулярной спецслужбы беспрецедентен, как и вся ситуация в Афганистане.
КНДР