В императорском указе Правительствующему Сенату от 14 декабря 1906 г. дается следующее обоснование учреждению чрезвычайной охраны на железных дорогах:
Объективно эти меры имеют весьма серьезное значение для государства при чрезвычайных обстоятельствах и особенно во время войны.
Проблема военнопленных
Война всегда связана с проблемой охраны военнопленных. Японцев, захваченных в плен, было немного. Отчет Военного министерства за 1905 г. называет общее число японских военнопленных: 107 офицеров и 1767 нижних чинов. Все они направлялись в с. Медведь Новгородской губернии, где размещались казарменным порядком в месте расположения 199-го пехотного резервного Свирского полка. Порядок их содержания определялся «Временным положением о военнопленных русско-японской войны» и особой инструкцией. Отношение к ним было гуманным. Из россиян в плену находилось свыше 1200 офицеров и 70 000 нижних чинов. Условия содержания были нелегкими, но русские солдаты и офицеры мужественно пронесли через плен свои достоинство и честь. Приведем в качестве примера достойного поведения в плену факт спасения полкового знамени группой военнослужащих из 162-го пехотного Ахалцыхского полка. 25 февраля 1905 г. в бою под Мукденом капитан Жирнов и знаменщик унтер-офицер Гришанов в рукопашной схватке отстояли знамя. Попавший в плен Гришанов прятал его у себя. Затем он передал полотнище поручику Хандажевскому, который восемь с половиной месяцев в условиях плена хранил у себя полковую реликвию. К моменту освобождения из плена никого из спасителей знамени в живых уже не было, об их подвиге рассказали очевидцы этой необыкновенной истории. Все трое были навсегда зачислены в списки полка. Между прочим, в этом же полку служил тогда и получил контузию во время боя подпоручик Константин Максимович Валобуев, впоследствии полковник русской армии, ставший первым командиром корпуса войск ВЧК, затем начальником войск внутренней охраны республики, участник четырех войн, комбриг, чья жизнь оборвалась в сорок втором под Москвой...
Во время войны Транссибирская магистраль была перегружена воинскими перевозками. Пересылка арестантов прекратилась. В Одессе в ожидании транспортировки морским путем на Сахалин скопилось множество арестантов. Ранее туда ежегодно отправлялось до 2 тыс. человек. Тюрьмы были переполнены.