Между тем уже тогда было неопровержимо доказано, что «Протоколы» – подделка, ремейк «Диалогов» Мориса Жоли. К этому мнению пришел даже видный русский государственный деятель, премьер-министр России и сам антисемит Петр Столыпин. Вопрос об авторстве «Протоколов» до конца не решен, но Чезаре де Микелис, опираясь на первое издание «Протоколов» в газете «Знамя», полагает, что создателями этого текста были известные русские националисты и антисемиты Павел Крушеван и Георгий Бутми. По мнению Микелиса, именно они перевели и доработали «Диалоги» Жоли.
Появление «Протоколов» и других подобных «исследований» должно было показать народу, кто такие «чужие», и направить его против них. В результате с 1903 по 1906 годы в России прокатилась вторая волна погромов, начавшаяся убийством 49 евреев в апреле 1903 года в Кишиневе. Насилие против еврейского населения значительно усилилось с началом первой русской революции в январе 1905 года. С января по октябрь 1905 года в Российской империи было отмечено 54 погрома. После подписания Манифеста 17 октября 1905 года, предоставлявшего населению умеренные политические свободы (которыми, впрочем, евреи были обойдены), до сентября 1906 года произошло около 650 погромов. Всего за этот период было убито 3103 еврея и около 20 тысяч ранено.
С 1911 по 1913 год тянулось «дело Бейлиса». Мендель Бейлис был обвинен в ритуальном убийстве 12-летнего Андрея Ющинского. Следует отметить, что после присоединения Польши, в которой кровавый навет имел долгую историю, об убиении евреями «христианских младенцев» не переставали говорить и в России на протяжении всего XIX века. Как отмечает электронная еврейская энциклопедия, время от времени процессы о ритуальных убийствах продолжали иметь место, например, в 1879 году в Кутаиси (именно этот процесс возбудил подозрения Достоевского).
В то же время бывший польский ксендз Ипполит Лютостанский, перешедший в православие, опубликовал пространный трактат о ритуальных убийствах. Он преподнес один экземпляр наследнику престола, будущему царю Александру III, который в ответ подарил ему кольцо с бриллиантами. Отсюда видно, до какой степени был силен антисемитизм в семье Романовых…
«Дело Бейлиса» развивалось следующим образом. Тело Андрея Ющинского, покрытое 47 колотыми ранами, было обнаружено в одном из киевских предместий 12 марта 1911 года. Сразу же после обнаружения трупа в полицию стали поступать анонимные письма о том, что убийство совершено евреями с целью извлечения христианской крови. В день похорон распространились прокламации с призывом «бить жидов», но лишь через несколько месяцев был подобран подходящий кандидат – еврей Мендель Бейлис, которому следствие решилось приписать убийство. Процесс длился два года и вызвал сильный резонанс как в России, так и за ее пределами. Хотя не только православная церковь, но и некоторые антисемиты (Шульгин) решительно отмежевались от судебной расправы, нашлось немало людей, в том числе и среди интеллектуалов, которые искренне поверили в виновность Бейлиса. Такую веру выразил, например, русский мыслитель Василий Розанов в своем сочинении «Обонятельное и осязательное отношение евреев к крови».
В конце концов, следствию удалось отыскать истинного виновника убийства. Виновной была признана скупщица краденного Вера Чеберяк, устранившая Андрея как случайного свидетеля ее грязного «бизнеса», причем «ритуальным» характером убийства она намеревалась отвести от себя подозрения.
Шок от погромов, новая волна ограничений, а также разочарование в позиции российского общества обусловили начало активного включения евреев в революционную борьбу. По словам Э. Хаберера, евреи стали «критической массой в русском революционном движении». Все более популярными среди еврейской молодежи становились социалистические идеи. В октябре 1897 года на нелегальном съезде представителей еврейских рабочих групп был создан Бунд (Всеобщий еврейский рабочий союз в Белоруссии, Литве, Польше и России).
Все это объясняет довольно значительный процент евреев, участвовавших в русских революциях 1905 и 1917 годов. В 1903 году Сергей Витте утверждал, что евреи составляют около половины членов революционных партий. Эта цифра вызывает у историков серьезные сомнения. По данным современных исследований, численность евреев в революционных партиях колебалась от 15 до 30 %. При этом численность евреев-революционеров составляла ничтожную долю еврейского населения России. Историк Будницкий пишет, что в сознании обывателей роль евреев в революции была намного большей, чем в реальности. Игорь Шафаревич, известный ученый, но при этом публицист антисемитской направленности отмечает в своей книге «Русофобия»: «Мысль, что «революцию делали одни евреи», – бессмыслица, выдуманная, вероятно, лишь затем, чтобы ее было проще опровергнуть. Более того, я не вижу никаких аргументов в пользу того, что евреи вообще «сделали» русскую революцию, то есть были ее инициаторами, хотя бы в виде руководящего меньшинства».