После победы над турками в 1774 году Екатерина ІІ решила ликвидировать Новую Сечь – последнее прибежище для украинских и русских беглых крепостных крестьян, в особенности опасное для властей в связи с крестьянской войной под началом Е. Пугачева 1773–1775 годов. Сам Пугачев хотел опереться на Причерноморье, он вел переговоры с крымским ханом о совместном походе на Москву. По приказу Г. Потемкина 5 июня 1775 года Новая Сечь была занята русскими войсками. Манифест Екатерины ІІ о ликвидации Запорожской Сечи сохранился:
«Мы захотели сообщить всем верноподданным целой нашей империи, что Запорожская Сечь окончательно разрушена, с искоренением на будущее и самого названия запорожских казаков, за обиду нашего императорского величества, за наглые поступки этих казаков и за непослушание нашим высочайшим повелениям.
Мы считаем ныне своим обязательством перед Богом, перед нашей империей и вообще перед самим обществом разрушить Запорожскую Сечь и имя казаков, полученное от нее. Вследствие чего 4 июня нашим генерал-поручиком Текели с доверенными ему нашими войсками занята Запорожская Сечь в совершенном порядке и полной тишине без всякого сопротивления со стороны казаков, потому что они увидели приближение войска, когда уже со всех сторон были окружены. Мы этому начальнику приказали наиспокойнейшим чином исполнить порученному ему дело, избегая, насколько это было возможно, кровопролития.
Сообщая нашим верным и любимым подданным про все эти обстоятельства, мы можем одновременно им сообщить, что нет теперь больше Запорожской Сечи и казаков этого имени».
Петр Калнышевский, «атаман Кошевого Войска Запорожского», был отправлен в Соловецкий монастырь, где провел почти четверть века. Н. Полонская-Василенко писала: