Видимо, шла борьба, скрытая или явная, между братом Борисом и царицей Натальей, которая стояла на том, чтобы князю Василию Голицыну отсекли голову. Верно, рассчитывала на то, что Фёдор Шакловитый оговорит его и тем даст повод обвинить в измене. И чтобы не допустить этого, князь Борис и решил лично вести сыск, а это значит, что он, его брат, будет сам читать опросные столбцы, сам и доставит их царю Петру. Это исключало всякий извет.
«И дай тебе Бог здоровья и крепости духа, князь Борис Алексеевич, чтобы выстоять перед напористой злобой царицы Натальи! Спасибо тебе за твою доброту и помощь в беде!»
Даже в часы молитвы князь Василий думал о брате своём.
А в это время подвергали жестоким пыткам ещё более несчастного, чем князь Василий, обречённого на невыносимые страдания человека, виновного лишь в том, что он, как и князь Василий, служил царевне Софье. Несколько раз на дню поднимали на дыбу Фёдора Шакловитого. В подземелье, где хранились монастырские запасы, расчистили место, поставили перекладину с блоком и петлёй, а внизу лежачее бревно с хомутом — средневековое сооружение, именуемое дыбой.
Из подземелья каменная лестница вела наверх, в каменный амбар, где был посажен на цепь Шакловитый. Когда приходил час вести его на пытку, внизу ставили скамьи для дьяков, обязанных записывать показания допрашиваемого, и обитую кумачом скамью для высших персон.
Розыск вёл князь Борис Голицын. Вызвался сам в надежде облегчить участь брата.
Царица Наталья догадывалась об этом. Опасаясь, как бы князь Борис не утаил каких-либо слов из показаний Шакловитого, она организовала свой тайный розыск, посадила в пыточном подземелье своих людей, которые должны были следить за всем, брать на заметку каждый шаг князя Бориса.
Пока ничто не обещало грозы. Вечерами Борис Алексеевич приходил к Петру с опросными столбцами. Пётр читал их, но в них осуждённый отрицал свою вину: умышлений на жизнь царя Петра и царицы Натальи не имел.
Пётр был недоволен ходом допроса, очевидно, под влиянием Натальи Кирилловны. Изредка приходил сам, с сумрачным видом сидел на табурете. Был сердит, что усердия страховидного палача, способного одним лишь ударом кулака переломить человеку хребет, не подвигали дело. Тогда князь Борис предложил Шакловитому самому написать правдивое изложение его участия в событиях. Принёс ему бумаги и чернил. Когда Шакловитый закончил свою исповедь — девять листов — князь взял написанное с собой, ибо было уже за полночь, царь спал.
Петру донесли об этом люди Натальи Кирилловны, и он хмуро встретил князя, когда тот вошёл к нему с бумагами: мол, тут злой умысел, князь вырвал из признаний подследственного то, что могло повредить его брату Василию. Царь Пётр грозно спросил князя Бориса, почему он не подал ему бумаги тотчас же. Князь ответил, что было уже поздно: как бы он посмел будить царя. Этот ответ удовлетворил Петра, но вызвал гнев Натальи Кирилловны. Она рассчитывала на казнь Шакловитого. А так как он был тесно связан с Софьей, то «доказанная» измена Шакловитого явилась бы обвинением и против Софьи, и против князя Василия Голицына.
Пётр не соглашался на казнь Шакловитого, возможно, под влиянием князя Бориса, однако Наталья Кирилловна, поддержанная патриархом Иоакимом, добилась казни верного слуги царевны Софьи.
После казни Шакловитого Наталья Кирилловна и патриарх Иоаким стали добиваться от царя Петра смертного приговора и для князя Василия Голицына. Но оба вскоре поняли, что сначала надо ослабить сопротивление князя Бориса Голицына. А для этого необходимо было настроить против него Петра.
Это оказалось трудным делом, ибо царь был привязан к своему любимцу. Наталья Кирилловна злилась, чувствуя своё бессилие. У неё не было иного способа, как унизить князя и затем оговорить его пред сыном. Обдумывая свой замысел, царица решила сделать князю внушение, хотя бы и в самой оскорбительной форме.
В одно непогожее сентябрьское утро Бориса Алексеевича пригласили в келью к царице. Он вошёл с почтительным поклоном, но к руке его не допустили, с ходу озадачив суровым вопросом:
— Ты почто мешаешься в царские дела? Может, и на царство посягаешь?
— Не ведаю, государыня-матушка, чем заслужил твою немилость. Ныне я веду сыск по слову царя Петра Алексеевича.
— Экую напраслину возводишь на государя! Всем ведомо: сам на допросные дела навязался. Где людям непригоже, там и твоя рожа.
«А ругань у неё прежняя, смоленской поры. Благопристойности так и не нажила, — подумал князь. — И эту женщину я когда-то ласкал и, кажется, любил».
— Дозволь сказать тебе, царица-государыня, на твои худые речи: вины за собой я не ведаю. Служу своему царю верно. За что же такая немилость?
— Нечего о службе-то вспоминать. Твоя служба нам ныне не надобна. Винись перед царём, что не можешь далее вести сыск.
— На то не моя воля, государыня. И государю я не привык докучать.
Царица Наталья насмешливо скривилась:
— Он ещё спорит со мной. А того не видит, что кафтанец его весь грязью заляпался.
— Государыня!