На пороге XVIII в. Петр I, не довольствуясь строительством судов на мелководных Воронежских верфях, перемещает основную корабельную «мастерскую» на север страны — в Архангельск и на Соломбальские острова. Со временем верфи разрастались. Расширялись парусное, канатное, железное и лесопильное производства, возводились новые, более совершенные стапели. В феврале 1703 г. на берегу реки Свирь начала работу еще одна крупная верфь, получившая название Олонецкой. Началась планомерная постройка боевых кораблей. Первые корабли соответствовали 4-му рангу английских кораблей, они имели высокие кормы с расположенными в них пушками и одну или две батарейные палубы.
Для того, чтобы вести одновременно две войны за выход к берегам Балтийского и Черного морей, требовались колоссальные ресурсы. Противостоящие державы — Швеция и Османская Империя — были одними из самых сильных в военном отношении держав того времени. Вести войну на два фронта было опасно, и неудачный Прутский поход ярко это показал. Петр отказывается, на время, от выхода к Черному морю, сдает Азов и продает Азовский флот. Все силы сосредотачиваются на Балтике.
Верфи у Ладожского озера имели, однако, весьма существенное неудобство: слишком уж далеки они были от балтийских вод. После долгих поисков Петр решает строить новую судоверфь на берегах Невы, и не просто верфь, а Адмиралтейство — верфь-крепость, которая смогла бы защитить молодой город от неприятельских судов. Проект Адмиралтейства был составлен самим царем-судостроителем 5 ноября 1704 года. Петр I позаботился о том, чтобы это событие не осталось незамеченным для истории. В поденном журнале царь оставил запись: «Ноябрь. В 5-й день, в неделю, заложили Адмиралтейский дом и были во остерии и веселились; длина 200 сажень, ширина 100 сажень».
Настоящее строительство крупных военных судов на петербургских верфях было развернуто в конце 1709 г., после того, как вступил в строй эллинг для больших кораблей. После поражения шведов под Полтавой, взятия Выборга, Ревеля, Риги строительство кораблей получило широкое развитие. Это было связано с тем, что потерпев сокрушительное поражение под Полтавой и не имея сил противостоять России на сухопутных фронтах, Швеция все еще обладала очень мощным флотом, который мог наглухо «закупорить» с таким трудом пробитое «окно в Европу», установив морскую блокаду и перехватывая русские торговые суда. Но к тому времени российские верфи заработали уже на полную силу.
Начиная с 1712 г., с верфей Адмиралтейства почти ежегодно сходит, по меньшей мере, два крупных корабля. В 1712 году был спущен на воду первый построенный в Петербурге 54-пушечный корабль «Полтава». Также строятся другие крупные линейные корабли — 60-пушечные корабли «Екатерина», «Нарва», «Ревель», «Шлиссельбург», «Ингерманланд» и «Москва».
Русские парусные суда, построенные на отечественных верфях под руководством непревзойденного «обер-сарваера» Ф.М. Скляева, И.М. Головина, Ивана Рамбурга и многих других российских корабелов, ни в чем не уступали иностранным кораблям. По сравнению с ранним флотом Петра периода Азовской кампании, балтийские суда имели более высокую корму и возросшую осадку. Благодаря совершенным обводам и пропорциям корпуса, они обладали высокой маневренностью и отменными мореходными качествами.
Петр же, будучи монархом, показал себя и как умелый политик, и как талантливый флотоводец, и, самое невероятное, — он остался верен своему увлечению кораблестроением и после «Предестинации». Так, Петр I сам спроектировал и заложил 54-пушечный корабль «открытого моря», получивший имя «Полтава». Корабль имел одну закрытую батарею, которая вооружалась 18-фунтовыми орудиями. На верхней открытой батарейной палубе стояли 12-ти и 3-х фунтовые пушки. Над транцем возвышалась кормовая раковина, богатая резьба которой изображала победу над шведским войском под Полтавой. Корабль принимал участие почти во всех кампаниях Балтийского флота во время Северной войны, а в 1713 г., прикрывая русские галеры при штурме Гельсингфорса, был флагманским судном Петра.
После «Полтавы», на главном Адмиралтействе был заложен целый ряд однотипных 60-пушечных линейных кораблей. И наиболее удачным из них стал «Ингерманланд», построенный талантливым мастером Е. Козенцем по чертежам Петра, — двухдечный корабль, который нес на борту 64 орудия. Двадцать четыре из них были тяжелыми 30-фунтовыми пушками. Корабль имел внушительные для того времени размеры: длину 52 м, ширину 14 м, глубину трюма 6 м. Парусное вооружение «Ингерманланда» было усовершенствовано, на его высоких мачтах появились третьи паруса — брамсели.
Вершиной судостроительного искусства Петра являлся спроектированный им первый трехдечный 100-пушечный линейный корабль «Петр I и II», который был заложен в 1723 г. на Санкт-Петербургской верфи и вступил в строй уже после смерти царя.