Постепенно компромисс “Восточной миссии” с военными был достигнут, но далеко не сразу и с большим трудом. Главным направлением подрывных действий стал Таиланд, позиция которого вызывала в тот период у англичан серьезную тревогу. Теоретически нейтральное, а на деле фактически прояпонское правительство в Бангкоке контролировало обширное государство. Прибывший с инспекцией в Малайю председатель Объединенного комитета по разведке (ОКР) Виктор Кавендиш-Бентинк 8 мая 1941 года указал, что в настоящий момент от секретных служб требуются не грандиозные операции на Дальнем Востоке, а политическое проникновение в Таиланд для поддержки его нейтралитета и противодействия возможному государственному перевороту в пользу японских ставленников, военное проникновение в целях организации в стране “пятой колонны” для поддержки возможного британского вторжения и подготовка к проведению там диверсионных акций. В результате с конца мая ФЕКБ и в особенности “Восточная миссия” СОЕ начали проводить на ТВД значительно более агрессивную политику. Летом 1941 года усилились слухи о предстоящем государственном перевороте в Таиланде, в связи с чем англичане начали готовить соответствующие контрмеры. В октябре Киллери попытался согласовать план действий с британским посланником в Бангкоке, однако, как и следовало ожидать, этот замысел потерпел полный провал. Джозия Кросби всегда энергично противодействовал даже куда более невинным попыткам спецслужб собственного государства вторгнуться в то, что он полагал исключительно своей сферой деятельности, теперь же его реакция оказалась крайне резкой. Он не только категорически отказался сотрудничать с СОЕ, но и обвинил руководителя “Восточной миссии” в разжигании страстей, о чем немедленно пожаловался в Лондон. В данной обстановке его протест был отклонен. Причина этого заключалась в том, что Исполнительный орган специальных операций был занят в Таиланде еще одной, крайне важной задачей. В рамках планировавшейся операции “Матадор” (превентивный удар британских войск по Таиланду с перешейка Кра) на будущем театре военных действий следовало провести тщательные рекогносцировки. Премьер-министр неофициально проинформировал англичан о том, что он не может противостоять все возрастающей активности японской разведки, но обещал не замечать появление в своей стране групп индийцев и европейцев в штатской одежде, совершающих необходимые мероприятия на местности. Эта задача была поручена СОЕ, которому разрешалось привлекать для ее решения офицеров 11-й индийской дивизии. С октября 1941 года в Таиланд группами по 3–4 человека прибыли 36 “туристов”, зачастую размещавшиеся в одних гостиницах с такими же японскими “туристами”. Из-за расовых различий СОЕ был вынужден вербовать нелегальную агентуру практически исключительно в среде таиландских шахтеров-южан, которые проходили обучение на территории Малайи, а затем без снаряжения перебрасывались обратно в Таиланд. Вооружение и средства взрывания завозились отдельно на грузовиках через почти не охраняемую границу. О “Матадоре” проинформировали американцев, расценивших эту операцию как агрессию и категорически возражавших против ее проведения.
17 ноября 1941 года руководитель ОМ Киллери предложил Лондону активизировать развертывание сил специальных операций в Таиланде и при этом во избежание конфликтов с посланником не информировать его о происходящем. С последним он опоздал, поскольку министр экономической войны Великобритании Хью Дальтон уже заверил министра иностранных дел Идена в том, что в нейтральных странах СОЕ будет действовать лишь при наличии соответствующих санкций послов или посланников. Но особого значения это не имело, поскольку ввиду важности подготовки операции “Матадор” Кросби запретили препятствовать “Восточной миссии”. К декабрю на юге Таиланда уже находились 24 оперативных работника СОЕ. Их задачей являлась организация партизанских действий по дезорганизации тыла предполагаемого противника в ходе осуществления операции “Матадор”, в первую очередь нанесение ущерба его транспортной инфраструктуре. Начать акции планировалось по сигналу радиовещательной станции из Сингапура. На практике этот план не оправдался, причем совершенно не по вине “Восточной миссии” СОЕ. После начала Войны на Дальнем Востоке главнокомандующий британскими силами Брук-Попхэм побоялся своевременно санкционировать начало специальных операций на территории формально нейтрального Таиланда, в результате чего время было безнадежно упущено. Нерешительность главкома дорого обошлась офицерам ОМ, 10 из которых погибли и 14 были интернированы. Единственным их успехом стал захват столичного аэропорта Пхукет и его удержание в течение двух дней, однако никакого реального влияния на ход кампании это не оказало.