В целом боевой состав подводных лодок 14-й дивизии обеспечивал полное превосходство над любым противником в Черном море. Но к концу 1996 г. произошло следующее: в составе флота осталась одна (!) боеспособная подводная лодка. Дизельная торпедная подводная лодка с экспериментальным водомерным двигателем Б-87Г смогла только в 1996 г. получить долгожданные аккумуляторы и начать практические выходы в море.
Вторая торпедная лодка — Б-435 (с 1997 г. «Запорожье») — стояла у плавпирса и в лучшем случае могла быть использована для учебных целей из-за невозможности погружаться и отсутствия аккумуляторов.
Третья лодка — Б-380 («Горьковский комсомолец») — в 1991 г. поставлена к причальной стенке Севморзавода для капитального ремонта.
19 февраля 1992 г. название «Горьковский комсомолец» было упразднено. Лодка предназначалась к передаче Украине, но ввиду плохого технического состояния Б-380 Киев отказался принять ее.
В 2000 г. правительство РФ решило отремонтировать Б-380 и ввести в боевой состав Черноморского флота. Лодка была введена в плавдок ПД-16. В 2008 г. ей присвоили имя «Святой князь Георгий». Увы, хоть средства на ее ремонт отпускались регулярно, на май 2014 г. она так и стояла в ПД-16 под гордо развевающимся Андреевским флагом.
Спустя 14 лет после начала ремонта вопрос о вводе Б-380 в боевой состав флота уже не стоит, ее хотят обратить в плавучую зарядовую станцию. Но, увы, трофейный германский док ПД-16 прогнил, и адмиралы с инженерами уже несколько лет думают, как его затопить, чтобы не пострадала лодка и не развалился док.
Остатки подводных сил Черноморского флота представляют три подводные лодки (СС-533, СС-226, СС-310) и переоборудованная в плавучую зарядовую станцию ПЗС-50 подводная лодка С-49, призванная заменить списываемую ПЗС-63.
Судьба остальных лодок Черноморского флота вкратце прослеживается следующим образом. «Варшавянки» (Б-177; Б-459; Б-471; Б-300) и пр. 641Б (Б-437, Б-498) были переведены к 1991 г. на Север, а отправленная на ремонт в Ленинград БС-555 в 1996 г. была разобрана на металл из-за отсутствия средств на ее модернизацию. В 1991 г. на слом в Турцию или Инкерманскую судоразделочную базу в Севастополе отправились субмарины: С-76; С-96; С-100; С-172; С-197; С-230; С-234; С-296; С-339; С-344; С-383 (пр. 613), Б-59 (пр. 641). Из состава флота вывели ракетную подводную лодку Б-318. Часть вышеназванных лодок класса «Виски» была списана до 1990 г. и не указана в перечне. В 1991 г. на слом пошли С-74; С-287; С-379 (пр. 613) и выведена из состава флота большая специальная лодка БС-153, на которой проводились испытания баллистических ракет РСМ- 52 комплекса Д-19. На следующий год были разобраны подводные лодки Б-6 и Б-105 (пр. 641), С-11 и С-37 класса «Ромео», С-70 и С-243 (пр. 613). В 1993 г. флот потерял С-384 (пр. 613) и Б-36 (пр. 641), а в 1994 г. сданы для разборки на металл Б-109; Б-326; Б-854 (пр. 641), С-128 (пр. 633КС) и С-376 (пр. 513). В 1995 г. была списана Б-67 (пр. 651) и разобрана Б-9, предназначенная для ВМС Украины, Лодка-мишень СС-256 также предназначалась для Украины и была основательно разграблена. Однако Украина от нее отказалась. 1 декабря 1997 г. СС-256 исключена из состава флота и в декабре 1999 г. отбуксирована в Очаков для разделки на металл.
Две ремонтирующиеся в Болгарии на заводе «Арсенал» (порт Варна) субмарины класса «Фокстрот» Б-41 и Б-326 из-за отсутствия финансирования были проданы на металл за долги.
Главную ударную силу Краснознаменного Черноморского флота в 1990 г. представляли 150-я бригада надводных кораблей и 30-я дивизия надводных кораблей (ДИНК), базировавшиеся на Севастополь.
В состав 150-й бригады входили два ракетных крейсера: «Слава» (пр. 1164) и «Адмирал Головко» (пр. 58), два больших ракетных корабля: «Сдержанный» (пр. 61М) и «Неуловимый» (пр. 56У), а также два больших противолодочных корабля — «Скорый» (пр. 61) и «Проворный» (пр. 61Э). Но в конце 1990 г. РКР «Слава» был отправлен в Николаев на капитальный ремонт и модернизацию. РКБ «Неуловимый» и БПК «Проворный» были выведены в резерв, а затем сданы на слом. Оставшиеся три единицы влились в состав 30-й дивизии, а сама 150-я бригада надводных кораблей прекратила свое существование.
13 ноября 2002 г. на крейсере «Адмирал Головко» спустили флаг. Затем корабль отправили на металл, хотя по техническому состоянию он мог прослужить еще несколько лет.