Очень многое дали казаки и развитию партизанского движения. Это развитие шло поэтапно. Сначала в годы Отечественной войны 1812 года, затем войны Гражданской, затем Великой Отечественной войны 1941–1945 гг.
О партизанском казачьем движении во время Гражданской войны хорошо написал В. Родионов в книге «Тихий Дон атамана Каледина»: «Дух казачества угасал в душах служилых казаков, но зато ярким пламенем он загорался в сердцах донской молодёжи, ставшей на защиту свободного Дона и поруганной России. На Дону народилось новое явление — партизанство. В среде партизан можно было встретить и старых, убелённых сединами, и молодых, безусых и безбородых, и казака, и офицера, и студента, и богатого, и бедного… Это были люди всех возрастов, всех положений, всех состояний, охваченных ненавистью к поработителям. Но ядром партизанства была учащаяся молодёжь — кадеты, гимназисты, реалисты, студенты, семинаристы — «Иисусова пехота».
Партизанство дало многих героев, многие подвиги превратились в легенды и перейдут в историю как светлые страницы трагической для казаков эпохи. Здесь, в партизанстве, ярко сияла казачья идея. Погибающий Дон в партизанстве звал своих верных сынов для своего спасения.
Во главе партизанства стояли:
— есаул (полковник) В. М. Чернецов; войсковой старшина Э. Ф. Семилетов; есаул Ф. М. Назаров; поручик В. Курочкин; есаул Роман Лазарев».
Начавшаяся Вторая мировая война, безусловно, была актом агрессии Германии и её сателлитов по отношению к другим странам, подвергнувшимся нападению противника. Со стороны СССР она была справедливой войной за независимость, целостность территорий, войной против вторжения оккупантов. Многие советские люди воевали не из страха перед заградительными отрядами, ими руководил патриотизм, вера в победу, вера в гениальность своего вождя — Иосифа Сталина (особенно у молодого поколения тех лет). Хоть и слабым, но отзвуком восстановления казачьего самоуправления стали события 1935–1936 г. г., когда Правительство СССР попыталось возродить казачьи части в Красной Армии, казакам разрешили носить казачью форму, а местные власти носить таковую обязали.
Отношение к войне, в самом её начале, у населения было неоднозначное. Более миллиона советских граждан и часть белоэмигрантов выступили на стороне Германии. Причины подобного «предательства» необходимо искать в революции, Гражданской войне, репрессиях, геноциде русского народа, коллективизации, раскулачивании и т. д. Кроме того, часть идеологов национал–социализма считали войну с Россией не акцией уничтожения и порабощения славян, а продолжением Гражданской войны в России.
Примечательно, что в течение всей войны вожди Рейха грезили идеей создания военных крестьянских поселений, которые должны были с востока защищать «среднеевропейское немецкое жизненное пространство». В качестве исторических параллелей и объектов для изучения были взяты два русских примера: казачьи поселения и идею Аракчеева о военных поселениях, где бы жители занимались и военным обучением, и сельскохозяйственными работами. Поэтому ничего удивительного в том, что П. И. Краснов создал и возглавил союзное Германии казачье формирование — ГУКВ (Главное управление казачьих войск) — нет. Но дела у него шли неважно. Казачий Стан насчитывал 12 тыс. человек (всего немцы пленили 5754000 советских военнослужащих). В состав Казачьего Стана входили донские, кубанские, терско–ставропольские казачьи бригады и полки, антисоветски настроенные военнопленные и дезертиры Красной Армии. Известный исторический факт, что во время немецкой оккупации сын атамана Краснова приезжал в донские станицы, в Краснодар и агитировал казаков вступать в специально сформированные казачьи полки. Ему удалось сформировать только два полка трёхэскадронного состава. Казаки, перешедшие на сторону немцев, как правило, были из числа всё потерявших при Советской власти. Потерявших не только имущество, но и лишившихся привычного образа жизни, как и другие сословия царской России.
Но основная масса проживавших в СССР казаков в немецкую армию не пошла, так как война эта была развязана Германией, враг с оружием в руках пришёл на русскую землю, а истинное призвание казачества во все века было защита России от агрессора.