Из Центрального архива Федеральной службы безопасности (ЦА ФСБ) в данном Сборнике представлены 15 документов за 1941–1943 гг., ранее рассекреченные и опубликованные в серии „Органы государственной безопасности СССР в Великой Отечественной войне“ и других изданиях. Без сомнения, открытие новых документов этого архива, особенно за период 1947–1952 гг., когда вся работа по борьбе с националистическим подпольем была передана в органы госбезопасности, является необходимым условием восстановления полной исторической картины того времени.
Не включены в Сборник документы внутренних и пограничных войск, принимавших активное участие в боевых действиях против националистов. Авторы надеются, что недостаточное освещение этой стороны проблемы будет восполнено после планируемого выпуска Сборника документов Центрального архива внутренних войск МВД РФ.
Сборник построен по хронологически тематическому принципу. Каждый раздел включает краткую статью, затем идут публикуемые документы. В первой главе даны минимальные сведения по истории рассматриваемых регионов до 1939 г.
Вторая глава охватывает период нацистской оккупации (1941–1943 гг.). Ее неполнота связана с использованием, в основном документов, хранящихся в России. Безусловно, желающие рассмотреть данный период более подробно должны обращаться как к архивам Белоруссии, Украины, Прибалтийских республик, так и к документам Германии. Отдельные документы, связанные с расследованием злодеяний националистов были созданы несколько позднее в 1944–1945 гг. Однако по тематическому принципу они включены именно в эту главу (док. № 32–36).
Наиболее полно отражен период 1944–1946 гг., когда сразу после освобождения рассматриваемых регионов от нацистской оккупации началась жестокая борьба между советскими властями и националистическими формированиями. Соответственно, третья глава получилась наиболее объемной.
В четвертой главе рассмотрен период 1947–1952 гг., когда после проведения массовых депортаций сочувствующего населения вооруженная борьба националистов постепенно сошла на нет. По указанным выше причинам число документов за этот период не так велико.
Пятая глава посвящена органам НКВД-МВД, боровшимся с националистическим подпольем. Авторы сочли целесообразным не дробить этот материал по хронологическим отрезкам, а дать его за весь период 1939–1953 и.