Но среди болельщиков были и те, кто думал иначе. Один фанат писал на интернет-платформе «Фасцинацион фанкурве» (нем.
В родном городе Гельзенкирхене на Нойера также обрушилась волна гнева из-за смены клуба. Он умолчал о своём решении из-за трудной ситуации в «Шальке».
После зимней паузы СМИ и фанаты начали ещё больше критиковать Феликса Магата. Подобный прецедент уже был в «Вольфсбурге», когда тренер и спортивный директор Магат вёл беспорядочную распродажу игроков. Никто не знал, что он собирается делать с перешедшими в «Шальке» на правах свободных агентов довольно посредственными игроками Ангелосом Харистеасом и Али Карими. Магата называли «королём дешёвого товара», который раздувает команду, не имея чёткой схемы. Спонсоры «Шальке» направили в наблюдательный совет письмо с просьбой остановить «безумие последних дней». Фанаты столкнулись с отчуждённостью и самоуправством Магата. Он пытался их успокоить через «Фейсбук», но это получилось скорее нелепо.
16 марта 2011 года Феликса Магата попросили немедля покинуть должность, несмотря на то что команда сыграла вничью в Валенсии (1:1), выиграла 3:1 в Гельзенкирхене и вышла в четвертьфинал Лиги чемпионов. Позднее Магат рассказывал, что «Шальке» стала чемпионом Германии благодаря ему и Нойеру, который стоял в воротах. Его преемником стал Ральф Рангник.
В эти неспокойные дни Мануэль Нойер выбрал крайне неудачный момент, чтобы заявить о своём переходе: «Я не хотел давать ещё больше поводов для беспокойства. Я подождал распределения позиций и тогда поговорил с менеджером Хорстом Хельдтом и тренером Ральфом Рангником. Всё было открыто и честно». Однако правильный момент был упущен, и у публики сложилось впечатление, что Нойер хотел её одурачить. Нойер рассказывает: «В то время мне пришлось нелегко. Я не знаю, правильно ли всегда оставаться таким преданным. Возможно, в будущем я должен больше думать о себе. Но я могу посмотреть в зеркало и сказать, что мне не в чем себя корить».
Так что Нойер молчал и следовал своим спортивным обязанностям. В четвертьфинале Лиги чемпионов «Шальке» едет в Милан на стадион «Джузеппе Меацца», место действия величайшего триумфа в истории клуба – победы в Кубке УЕФА в 1997 году против того же соперника. Почти 14 лет спустя матч начался для «Шальке» ударом ниже пояса: всего через 26 секунд после стартового свистка «Интер» вышел вперёд – 1:0. Эстебан Камбьяссо отдал передачу на Диего Милито, но Нойер ещё на границе штрафной площади отбил мяч головой. Тот отлетел почти к центральной линии, и Деян Станкович ударом с лёту, без подготовки, отправил его в пустые ворота. Однако в конце концов, «горнякам» и их фанатам довелось пережить ещё один волшебный матч в Милане. Команда Ральфа Рангникса сенсационно выиграла у «Интера» 5:2. На своём поле «Шальке» ограничился победой 2:1. Таким образом, «Шальке» наряду с «Манчестер Юнайтед», «Реалом» и «Барселоной» вышел в полуфинал Лиги чемпионов.