При Карле I губернаторы стали назначаться королем, но, вследствие дальности расстояния и невозможности отправлять большие военные силы в колонии, король был вынужден согласиться на сохранение некоторых элементов самоуправления. Борьба виргинцев за свое право на представительное управление, каким оно сложилось в первые годы, привела в 1635 г. к смещению королевского губернатора и утверждению в этой должности назначенца американских плантаторов. Воспользовавшись революцией 1640 г., а затем просчетами в политике Оливера Кромвеля, виргинцы с 1652 г. стали сами избирать губернатора и членов колониального совета. Лишь Реставрация Стюартов и силовое давление на виргинскую элиту позволило через десятилетие вернуть непокорную территорию под непосредственное управление монархии. Опыт парламентаризма не прошел бесследно, подпитывая на протяжении последующего столетия недовольство виргинских собственников притеснениями колониальных властей.
Большинство колоний этого типа, основанных частновладельческими компаниями, в разное время были изъяты из-под управления акционеров и переданы королю вместе с правом назначения губернаторов. Так называемыми королевскими провинциями стали Северная и Южная Каролины, Джорджия и ряд других колоний. Повсюду в них применялся рабский труд.
Колонии второй группы были основаны переселенцами-единоверцами, бежавшими от обострения религиозных противоречий в Англии. Новый Плимут, откуда в дальнейшем взяла начало Новая Англия, основали на северо-востоке страны в 1620 г. английские пуритане-сепаратисты. Спасаясь от религиозных притеснений, они перебрались в 1607–1608 гг. сначала в освободившуюся от испанцев Голландию, а после полученного от короля Якова разрешения – в Виргинию. В Виргинию пуритане-сепаратисты плыли на корабле «Мэйфлауэр» и, изменив курс, высадились чуть севернее. Индейцы не оказали противодействия переселенцам, поскольку за три года до этого значительная часть аборигенов погибла от эпидемии чумы, оставив пустующими свои поля.
Поскольку эта территория не контролировалась Плимутской компанией, под эгидой которой переселенцы прибыли в Америку, назначение губернатора обычным путем оказалось невозможно и переселенцам пришлось его избрать. Пассажиры «Мэйфлауэра», среди которых лишь небольшая часть была пуританами-сепаратистами, еще в ходе плавания подписали Мэйфлауэрское соглашение, в котором договорились о безусловном подчинении законам, коллективно выработанным жителями нового поселения. В нем были изложены принципы самоуправления, предусматривавшие демократические гражданские свободы. После первой зимовки, обеспеченной хорошим урожаем, колонистам удалось расплатиться за перевозку с плимутскими купцами и начать освоение окрестных земель. Праздник первого урожая колонистов положил начало ежегодно встречаемому Дню благодарения в четвертый четверг ноября.
Удачный опыт плимутцев побудил состоятельных английских пуритан во главе с будущим губернатором Джоном Уинтропом воспользоваться стремлением короны вытеснить их из страны и получить от Карла I разрешение на создание своей переселенческой «Мореплавательной компании Массачусетса» со штаб-квартирой в Новой Англии. В 1630 г. на берегу залива Массачусетс Уинтроп основал Бостон. Вокруг города стали быстро расти поселения пуритан, переезд которых финансировали единоверцы (к 1640 г. население Новой Англии в несколько раз превысило число жителей Виргинии). Главной целью объявлялось создание «града на холме», который бы в полной мере соответствовал Священному Писанию. Кальвинисты Массачусетса воспроизводили суровые ветхозаветные порядки: беспощадно истребляли краснокожих язычников, массами казнили мнимых колдунов и ведьм, преследовали развлечения и игры, чтили и строго соблюдали субботний день.
Ортодоксальные пуританские священнослужители пользовались в Массачусетсе большим влиянием, даже после того, как колония была переведена под юрисдикцию короля. Несмотря на декларативное подчинение метрополии, даже умеренные пуритане во главе с Уинтропом, трепетно относились к элементам самоуправления, правом участия в котором обладала только имущая верхушка и часть послушной паствы из средних слоев. В ходе Английской революции 1640 г. массачусетцы выступали горячими сторонниками пуританского парламента.
В то же время, вопреки жесткой религиозной дисциплине, Новая Англия стала колыбелью зарождавшегося самосознания американцев, самобытной культурной и политической традиции. В Кембридже была построена первая школа для детей переселенцев, через три года, в 1639 г. превратившаяся в Гарвардский колледж. Были созданы первые типографии. Именно в Новой Англии зародились идеи американского просвещения. Под влиянием этого «Великого пробуждения» в начале XVIII в. в Массачусетсе удалось покончить с теократическим правлением и доминированием конгрегационалистской церкви, созданной Уинтропом.