В 1950 году Маклин вернулся в Англию. Через некоторое время он получил новое назначение. Он стал заведующим американским отделом министерства иностранных дел. Центр разработал план по восстановлению связи с источником и продолжению работы с ним в Англии.
Однако в мае 1951 года обстановка вокруг Маклина начала осложняться. Американцы, занимавшиеся радиоперехватом наших радиограмм, одновременно проводили работу по их дешифровке. Не один год прошел впустую. Им долго не удавалось раскрыть советские шифры. Проводили эту работу и англичане. Они даже прибегали к таким ухищрениям, как инспирация в парламенте заявлений по каким-либо щекотливым вопросам, полагая, что советская разведка и посольство дадут текст заявления в своих шифртелеграммах. Они считали, что, нащупав текст заявления, они выявят ключ к шифру и раскроют и сам шифр. Однако успехов это не приносило.
Американцы были удачливее. Они по сообщениям в западной прессе сумели прочитать несколько отрывков из телеграмм, направлявшихся нашей резидентурой из США. В июне 1950 года им удалось восстановить отдельные фрагменты шифртелеграммы, посланной в Москву в 1945 году резидентурой внешней разведки в США. В телеграмме сообщалось о секретных англо-американских переговорах. Американцы сообщили об этом англичанам. Английская контрразведка определила, что содержание этой информации было известно только восьми лицам. Пользуясь методом исключения, англичане установили, что сведения об этих переговорах советская разведка могла получить лишь от двух лиц, одним из которых являлся Маклин. Английская контрразведка организовала негласное расследование этого дела и установила за Маклином слежку.
Одновременно с английской контрразведкой за развитием событий внимательно следил Ким Филби — советский разведчик, работавший в английской разведке. В это время он находился в США, являясь представителем СИС в ЦРУ. Он своевременно получил от руководителей ЦРУ информацию и решил действовать без промедления. В США в это время был Гай Берджесс — другой источник внешней разведки, который был связан с ним. Филби информировал его о надвигающейся опасности и предложил срочно выехать в Англию, поставить перед советскими товарищами вопрос о немедленном выводе Маклина в СССР. Филби настаивал также на том, чтобы Берджесс сопровождал Дональда до обусловленного пункта на континенте, а затем возвратился в Англию. Берджесс прибыл в Англию и занялся спасением Маклина.
Руководство внешней разведки не замедлило с ответом. Резидент получил указание принять все необходимые меры к отправке в СССР Маклина и согласился с предложением, чтобы Берджесс сопровождал его в пути.
Однако выехать из Англии было нелегко. Маклин уже находился под плотным наружным наблюдением. Контакт с резидентурой поддерживался через Берджесса, а он, как сотрудник министерства иностранных дел, заходил в кабинет к Маклину, заводил разговор на нейтральные темы, тем временем писал на бумаге, что тот должен делать. Эта предосторожность осуществлялась потому, что кабинет Маклина наверняка уже прослушивался контрразведкой.
Вечером в пятницу 25 мая 1951 года Берджесс заехал домой к Маклину, они объявили домашним, что заедут на часок в клуб. Дональд прошел наверх, поцеловал детей, жену, и они выехали из дома.
Поездка в клуб была лишь предлогом, на самом деле у Берджесса в кармане уже лежали два билета на пароход, отплывавший через полчаса во Францию. Они в последний момент успели сесть на судно, а через несколько часов были в Париже.
Отъезд прошел спокойно, наружного наблюдения не было, начинались выходные дни, и контрразведка, видимо, ограничилась техническим контролем. Да и поведение подопечного не вызывало беспокойства. По внешним признакам можно было заключить, что выезжать он никуда не собирался. Как стало известно позже, контрразведка планировала провести допрос Маклина в следующий понедельник. Но этому не суждено было сбыться. Из Франции путь разведчиков лежал в Швейцарию и Чехословакию. А в воскресенье они были в Москве. (Берджесс решил последовать за Маклином.)
В судьбе Маклина начался новый период. Он прожил в СССР почти 30 лет. Сначала его по соображениям безопасности поселили в Куйбышеве, где он и жил до 1955 года. Затем он попросил перевести его в Москву или Ленинград. К нему приехала жена с детьми, семья получила советское гражданство.
После переезда в Москву Маклин сначала был сотрудником журнала «Международная жизнь», а затем перешел в Институт мировой экономики и международных отношений, где проработал до конца жизни. Одновременно он был консультантом во внешней разведке.
Будучи старшим научным сотрудником, Маклин подготовил несколько научных работ, защитил кандидатскую, затем докторскую диссертацию на тему «Внешняя политика Англии после Суэца». Она получила высокую оценку и была опубликована в СССР, Англии и США.
Маклин пользовался большим авторитетом в научном мире нашей страны. Выступал на конференциях, симпозиумах, к нему обращались за консультациями ученые и авторитетные специалисты в области международных отношений.