12 мая 1992 г. глава исполнительной власти Шушинского района Низами Бахманов прибыл в Баку, где встретился с Ягубом Мамедовым. Как говорит Низами Бахманов, 12 мая он застал в кабинете Ягуба Мамедова бывшего президента Аяза Муталибова, который попросил в течение одной недели не предпринимать никаких действий, что 15 мая все само собой встанет на свои места и Шуша будет отвоевана обратно.
Вечером 12 мая начались факты неповиновения войск. Так, в Лачине бойцами Лачинского полка был избит начальник оперативного управления генерального шиаба полковник Руфат Амиров, которого потом выгнали из района. В ночь с 12 на 13 мая в штабе Лачинского полка был избит командир 704-й МСБР Эльбрус Оруджев и также выгнан из Лачинского района. После этого Эльбрус Оруджев выехал в Евлах, где размещался передовой командный пункт министра обороны Рагима Газиева.
Сам Рагим Газиев 11–12 мая 1992 г. провел в Гяндже и Евлахе, где решал вопросы снабжения, отправки в Шушинский район подкреплений и боевой техники и подготовки операции по возвращению Шуши. Также в Евлах прибыл начальник генштаба Шахин Мусаев. Одновременно шла переброска войск в Тертерский, Агдамский и Ходжавендский районы для участия в операции. Планировалось с этих направлений нанести отвлекающие удары, в то время как основные силы будут проводить операцию по освобождению Шуши. Так, в с. Куропаткино Ходжавендского района был переброшен Ленкоранский батальон под командованием Алакрама Гумбатова. Активное участие в подготовке операции принимало «Военное единство» под руководством Сурета Гусейнова. Операция по возвращению Шуши планировалась на 17 мая 1992 г.
12 мая 1992 г. прошло заседание парламента (Милли Шура). Первым выступил первый вице-премьер Вахид Ахмедов: «Я уже три дня участвую в работе военного штаба. Всеми операциями в Шуше руководит Шахин Мусаев. В Шуше был гарнизон 2000 человек, оснащённый всем необходимым. С Шушой не было ни телефонной связи, ни радиосвязи. Как могли сдать Шушу, непонятно. Идут какие-то политические игры. С фронта Лачин, Агдам, Губадлы выводятся воинские части, которые направляются в Баку. С какой целью и кем это делается – непонятно. Рагим Газиев неоднократно ездил в Москву и вёл переговоры с Грачевым. Но пока безрезультатно. Нам удалось получить пять БМП и пять БТР от российских войск. Нет единого управления войсками, военные дела запущены. Если дела так пойдут, то армяне захватят и Физули, и Барду, и Гянджу. Азербайджан в очень тяжелом положении. Если мы не заключим военный и экономический договор с Россией, то сильно проиграем. Другого выхода нет. Ни Иран, ни Турция нам пока даже одной единицы оружия не передали. От них нам нет никакой помощи, и я не думаю, что будет какая-то помощь в будущем. В республике нет дисциплинированной и организованной армии, никто ничьи команды не принимает, никакие команды не выполняются, контрразведки нет. Если этого нет, то о какой войне может идти речь? Цель России поставить нас на колени до 15 мая, и они уже поставили нас на колени. Нечего скрывать. В Лачине тяжелая обстановка, оттуда все бегут. В Тертере и других районах тоже очень сложная ситуация. До этого нас довела наша же политика. Как получилось, что Армения смогла найти общий язык с Россией, а мы нет? Беларусь и Украина могут находить общий язык с Россией, а мы нет? В этом мы все виноваты». Исполняющий обязанности президента и председатель Верховного Совета Ягуб Мамедов заявил: «В город с фронта проникло много вооруженных отрядов. Для пресечения их проникновения в город выставлены пикеты на въездах. Дано указание о разоружении этих отрядов». Депутат от НФА Иса Гамбаров: «До 15 мая готовится переворот с целью возвращения к власти бывшего руководства. Это делается под контролем Москвы». После дискуссий принимается решение созвать 14 мая сессию Верховного Совета.