Мнение представителей Академии наук СССР, имевших более чем обширные возможности для изучения феномена, вызывает уважение, однако стоит вспомнить, что аналогичная позиция американских академиков была инспирирована ЦРУ, убившим одним выстрелом сразу двух зайцев: с одной стороны, они смогли тщательно и всесторонне исследовать эту загадку с помощью ведущих научных умов; а с другой стороны, авторитет академической науки был использован для «развенчания» феномена НЛО. Поэтому нет ничего удивительного, что Комитет государственной безопасности учел опыт ЦРУ и в схожей ситуации пошел по схожему пути.
Параллельно с «разоблачениями» по линии академической науки расширяются засекреченные исследования НЛО советскими военными специалистами и разведчиками. Они неоднократно замечали, что неопознанные летающие объекты появлялись там, где возникала повышенная военная активность, связанная, например, с транспортировкой «особых» грузов. Исходя из этого, советские военные научились даже создавать ситуации, при которых можно искусственно, по своему желанию вызывать появление НЛО. Для этого достаточно симулировать или обозначить перевозку «особых» грузов, и почти всегда в этом месте появлялся неопознанный летающий объект.
Сотрудник Центра космической связи генерал-майор авиации В. В. Алексеев в 1997 году сделал одно сенсационное заявление:
«Я знаю, что на некоторых полигонах, я не буду их называть, хотя на сегодняшний день это уже не тайна, научились даже входить в определенный контакт. В чем он заключался. Сначала появление НЛО. Это в большинстве случаев шары, но не только. Путем физического обозначения своего поведения — скажем, разведением рук в разные стороны — подавался сигнал. Шар так же сплющивался в ту же сторону. Если руки поднимали вверх три раза, то НЛО сплющивался в вертикальной плоскости, и тоже три раза. В начале 80-х годов, по решению еще бывшего советского руководства, проводились эксперименты с использованием техники (теодолиты, радиолокационные станции и другие), в результате чего неопознанные объекты регистрировались на конкретных приборах».
Как отмечают специалисты, с мест поступало очень много разной информации. Так, например, сотрудники одного из исследовательских учреждений в Подмосковье вылетели в Новосибирск для расследования авиационной катастрофы. После их прилета ими был написан отчет о том, что имела место встреча с НЛО, который сопровождал их самолет в воздухе. Будучи людьми грамотными и склонными к научному анализу, члены комиссии распределили роли таким образом, чтобы одни из них наблюдали и диктовали, другие рисовали, третьи вели отсчет времени.
Выводы из доклада другой государственной комиссии, работавшей на одном из полигонов Волгоградской области, содержали несколько версий происхождения феномена НЛО. С одной стороны, допускалась возможность неизвестных нам природных явлений. С другой стороны, не исключалась возможность того, что это одна из форм разведывательной деятельности. Наконец, третьей основной версией была версия о возможной принадлежности НЛО к внеземной цивилизации.
В. А. Алексеев так описывает свое участие в работе по изучению «летающих тарелок» в советское время:
«По роду своей деятельности мне приходилось получать информацию из разных воинских частей на территории России, а тогда бывшего Союза. Я знал, что существуют группы, которые занимаются исследованиями, но на то время уровень закрытости этого вопроса ограничивался тем, что происходило получение информации с последующим отправлением ее наверх. Мы люди военные, объяснений каких-либо не было. Вопрос ставился так: нас интересует то-то. Затем показывалась таблица с изображением всех когда-либо зафиксированных форм НЛО — порядка полусотни, начиная от эллипсов, шаров и кончая чем-то, напоминающим космические корабли и так далее. Очевидцам задавался вопрос о том, на что „то“ было похоже, затем делали привязку к местности и т. д., затем все эти материалы уходили».
Этим авторитетным заявлением полностью опровергается утверждение представителя ПВО генерал-полковника Геннадия Решетникова о том, что в рамках деятельности Вооруженных Сил не было каких-либо специальных исследований проблемы НЛО и засекречивания полученных результатов.