Президент Саакашвили, выступая перед участниками, заявил:
При этом он назвал Абхазию и Южную Осетию «кагэбэшными анклавами, где осуществляются мечты Дзержинского, Ежова, Берии и особенно Андропова, которого идеализируют в одном из крупных государств».
20 февраля 2006 года Грузия сняла блокаду всех дорог, ведущих в Южную Осетию, уладив таким образом очередное осложнение в отношениях между Тбилиси и Цхинвалом, начавшееся с того, что военные Южной Осетии отказались пропустить на свою территорию грузинских миротворцев, следовавших к месту несения службы в селе Ачабети на территории Южной Осетии. Кризис удалось разрешить на трехстороннем совещании командования российских и грузинских миротворцев при участии представителей МВД Южной Осетии. Грузинским военнослужащим было разрешено проследовать к месту своей дислокации в сопровождении российских миротворцев.
В связи с заявлением Грузии о необходимости расширения состава миротворцев в зоне грузино-осетинского конфликта за счет Украины и других стран Министерство иностранных дел Украины 21 февраля 2006 года сообщило о готовности направить миротворцев при условии соответствующего мандата ООН или ОБСЕ и соответствующего решения Верховной рады.
Лидер Южной Осетии Эдуард Кокойты 22 февраля 2006 года выступил против расширения миротворческого контингента в зоне грузино-осетинского конфликта, заявив, что не видит альтернативы российским войскам. По его словам, односторонние действия Грузии являются
Президент Южной Осетии Эдуард Кокойты пообещал в ближайшее время обратиться в Конституционный суд Российской Федерации с документами, свидетельствующими о том, что республика всегда оставалась в составе России. По его словам, Южная Осетия и Северная Осетия вошли в состав Российской империи как единое целое, и Южная Осетия никогда не выходила из состава России. Кокойты утверждает, что у республики есть все документы о вхождении в состав России, но нет ни одного юридического документа, который бы свидетельствовал о выходе из состава России.
Глава комитета Госдумы РФ по делам СНГ и связям с соотечественниками Андрей Кокошин заявил, что
Необходимо отметить, что гражданами России является абсолютное большинство жителей Южной Осетии.
В феврале 2006 года Эдуард Кокойты обвинил Тбилиси в подготовке спецоперации по уничтожению руководства Южной Осетии, в том числе и его самого. В марте 2006 года он подал в Конституционный суд РФ заявление о присоединении непризнанной республики к Российской Федерации.
14 июня 2006 года главы Южной Осетии, Абхазии, Приднестровья – Эдуард Кокойты, Сергей Багапш и Игорь Смирнов – подписали декларацию о сотрудничестве. В этом документе говорилось о намерении непризнанных республик создать совместные миротворческие силы в том случае, если из зон конфликтов выведут российских миротворцев. В документе подчеркивалось стремление трех непризнанных государств развивать отношения с Россией.
15 августа 2006 года республика начала выдавать собственные паспорта. Ранее жители Южной Осетии пользовались паспортами СССР, а также российскими паспортами, полученными в соответствии со статьей 14.1 ФЗ «О гражданстве РФ».
12 ноября 2006 года президентом Южной Осетии вновь был избран Эдуард Кокойты, набравший 96 процентов голосов избирателей. Одновременно с выборами президента проходил референдум, на котором 99 процентов проголосовавших жителей Южной Осетии высказались за независимость (явка избирателей составила 95,2 процента); референдум не был признан международным сообществом. На альтернативных выборах в селах (преимущественно грузинских), контролируемых правительством Грузии, победил Дмитрий Санакоев, бывший военный министр и глава правительства Южной Осетии, возглавивший прогрузинскую администрацию Цхинвальского региона в селе Курта.
С этого момента переговорный процесс между грузинской стороной и Южной Осетией о разрешении конфликта прекратился.