Глаза могут иметь различные оттенки — от темно-коричневых до светло-желтых. Предпочтительным является более темный цвет глаз. Народные методы селекции, естественно, цвету глаз не придают никакого значения, как хозяйственно бесполезному признаку.
Весьма строго современные стандарты всех служебных пород относятся к зубной системе собаки. Здесь нет никаких разночтений — прикус должен быть только ножницеобразный и все зубы в полном комплекте. Однако среди среднеазиатских овчарок часто встречается клещеобразный прикус. И вероятно, у собак старших возрастов при широкой и тупой морде, когда трилистники резцов стираются, исходный ножницеобразный прикус переходит в клещеобразный.
Голубая мечта многих собаководов — не браковать такой прикус на выставках. В работе Юдиных («Охота и охотничье хозяйство», 1977, № 10) показано, что и у волков тенденция перехода прикуса к прямому наблюдается уже с трехлетнего возраста. Авторы такое изменение прикуса считают закономерной возрастной изменчивостью и предлагают оценку состояния зубной системы собак проводить до трехлетнего возраста.
Перекус же является уродливой формой смыкания зубов, и собаки с таким прикусом должны исключаться из племенного разведения независимо от прочих достоинств.
Солидарны с Юдиными и А.Т. и С.Д. Войлочниковы (см.: Охотничьи лайки, М.: Лесная промышленность, 1982). Однако доктор биологических наук Е.К. Меркурьева, говоря о быстром распространении неправильного прикуса по породе, решительно высказывается об устранении из племенной работы не только собак с неправильным прикусом, но и тех, у кого «зубы на пределе», так как они могут давать потомство с сильно выраженным пороком прикуса.
Что касается среднеазиатской овчарки, то пока порода существует на уровне примитивной, в районах ее основного распространения на прикус никто обращать внимания не будет. В клубах служебного собаководства при завозе поголовья с мест обитания мы будем встречаться с самыми разнообразными прикусами.
В качестве иллюстрации можно привести результаты экспертизы туркменских овчарок на XI Всесоюзном смотре служебного собаководства 1935 года. Как отмечает в описании туркменских овчарок эксперт А.П. Мазовер, из 19 собак у четырех отмечен прямой прикус, у четырех недокус и у одной — смешанный. В конце 60-х — начале 70-х годов в Ленинград из разных районов Средней Азии от неродственных производителей было завезено 10 собак. У двух из них прикус был ножницеобразный, у двух к двум годам — на пределе, а у остальных — клещеобразный. Причем ножницеобразный прикус имели самые легкие, с малообъемной головой собаки.
Значительный перекус, равно как и недокус, безусловно, следует выбраковывать. Клещеобразный же прикус, особенно появившийся впервые в зрелом возрасте, вероятно, выбраковывать нежелательно, иначе можно лишиться значительной части племенного поголовья.
Видимо, это было бы и неправильно, если считать, что наиболее желательной для среднеазиатской овчарки является объемная широкая морда с соотношением длины морды к длине головы чуть более 1/3. Учитывать же состояние, прикуса при подборе пар необходимо.
Вероятно, у всех служебных пород, и у среднеазиатских овчарок в том числе, можно допускать отсутствие третьих моляров. В семействе псовых род Cuon (азиатский красный волк) отличается от остальных родов тем, что имеет по два моляра в верхней и нижней челюсти с каждой стороны. Учитывая гомологичность признака, всегда можно ожидать его появления у других родов семейства, в том числе и у рода Canis.
Кроме того, в зарубежном собаководстве отсутствие М-3 и даже P-1 и Р-2, резца, так же как и клещи по двум зацепам, в ряде пород не являются препятствием для участия в племенной работе. Дело селекционеров внутри каждого клуба решать, каким недостатком на данном этапе развития породы в зависимости от количества и качества собак можно пренебречь, а на какой обратить особое внимание и не допустить его носителей в разведение конкретного клуба. Но животные со значительным перекусом, равно как и с недокусом, не должны участвовать в разведении нигде.
Шея среднеазиатской овчарки недлинная, несколько короче или равна длине головы, очень мускулистая, часто с подвесом, под углом примерно 30° по отношению к линии спины.
Для строения грудной клетки среднеазиатской овчарки характерен округлый изгиб ребер. Ребра у нее более изогнуты, чем у других служебных пород.
Ш. Джакашев в статье «Морфология области позвоночно-реберных соединений» (Труды Алма-атинского ветеринарного зоотехнического института, т.6. 1949) указывает, что в строении позвонков у хищных имеется резко выраженная граница между локомоторным и респираторным отделами, которая приходится на 10-11-й грудной позвонок. У собаки грудная клетка является более интенсивно респираторной, чем у других животных, к концу грудной клетки респираторная роль ребер все более возрастает, но и опорные первые 3—4 ребра также более подвижны. Большая кривизна ребер указывает на их большую подвижность и меньшую опорную роль.