В 1906 году Кокошкина избирают в Первую Государственную Думу, где он становится товарищем секретаря Думы, входит в кадетскую фракцию. Когда царь распустил Думу, считая принятый ею закон о земле недействительным, 169 бывших думцев собрались в Выборге и обратились к народу с "Воззванием" к пассивному сопротивлению: не платить налоги и подати, уклоняться от воинской службы. Все участники и подписанты "Выборгского воззвания" подверглись судебному преследованию. Ф.Ф., как и другие бывшие думцы, получил "срок" и отбыл в тюрьме три месяца. Кокошкин был вынужден уйти из Московского университета и преподавал только в частном университете А.Л.Шанявского, куда принимались люди независимо от национальности и политических взглядов. Ф.Ф. читал лекции в Сорбонне и Кембридже, куда вместе с семьей ездил каждое лето.
Начавшаяся первая мировая война застала семью Кокошкиных за границей. По воспоминаниям Ирины Федоровны, семья тут же собралась и отправилась домой. Добравшись до пункта, где поезда уже не ходили, они бросили чемоданы и с детьми пешком дошли до границы. Ступив на русскую землю, отец воскликнул: "Какое счастье! Мы дома!" Эти отцовские слова дочь помнила всю жизнь.
После февральской революции Кокошкин в качестве члена Временного Совета входит в правительство. Он участвует в кампании по выборам в Учредительное собрание, и Москва называет его своим депутатом. Учредительное собрание начинает работу 5 января 1918 года в Петрограде. После разгона собрания Кокошкина, остановившегося в доме графини Паниной, арестовывают. В тюрьме очень холодно, и Кокошкин получает воспаление легких. Ф.Ф. отправляют в Мариинскую больницу.
Федор Иванович Шаляпин так описал дальнейшие события:
Позднее выяснилось, что убийство совершили матросы-анархисты. Похороны последнего Федора Федоровича Кокошкина состоялись в Петрограде при большом стечении народа и вылились в манифестацию протеста.
Вдове Кокошкина Марии Филипповне была назначена пожизненная персональная пенсия за мужа. Близкое участие в судьбе семьи принял Максим Горький, хорошо знавший Кокошкина. Марии Филипповне нашли работу у Екатерины Павловны Пешковой в Лиге спасения детей.
Одиннадцать лет назад Наталья Руновская так закончила свое повествование о династии Кокошкиных:
Добавлю: и хороший зеленый поселок, с воздухом, не загрязняемым автомобильными и промышленными выбросами.
Поменяли местами
По территории Наро-Фоминского района протекают четыре, учитывая их величину, скажем так, несудоходных реки: Протва, Нара, Пахра и Десна. Протва из них самая длинная (275 км), Десна – самая короткая (около 60 км). В прошлом, однако, реки играли куда более значительную роль не только из-за способности нести на своих водах купеческие суденышки. С этим уже не поспоришь и рекам не поможешь. Было у них еще одно достоинство – прозрачная, холодная до ломоты в зубах, чистая вода.