Затем Боевая организация провела 29 июля 1902 г. неудавшееся покушение на харьковского генерал-губернатора Оболенского (стрелявший промахнулся), а в мае 1903 г. член организации, слесарь уфимских железнодорожных мастерских, убил уфимского губернатора Богдановича. За этим террористическим актом последовала пауза, вызванная волной арестов в Киеве, Одессе, Москве, Петербурге, Курске, Саратове. Был арестован и руководитель Боевой организации Гершуни, преемником которого на этом посту стал Е. Азеф, названный позднее «великим провокатором». Под его руководством началась подготовка убийства министра внутренних дел Плеве. 15 июля 1904 г. бомбой, брошенной Сазоновым, Плеве был убит, а сам террорист тяжело ранен. В связи с этим актом партия социалистов-революционеров выпустила воззвания «Ко всем рабочим», «15 июля», «Ко всему русскому крестьянству», «Надгробное слово временщику».
После покушения на Плеве в августе 1904 г. был принят устав Боевой организации. В нем была сформулирована задача Боевой организации — борьба с самодержавием путем террористических актов, Определены ее структура и особое положение в партии. Руководящим органом Боевой организации являлся комитет, которому были подчинены все ее члены. Комитету принадлежало право приема новых и исключения старых членов (решение должно было быть единогласным); право участия в написании литературных произведений, издаваемых от имени организации; право участия в составлении плана действий, причем в случае разногласий между членами комитета решающий голос принадлежал члену-распорядителю. Этот член-распорядитель, фактический руководитель Боевой организации, избирался и сменялся по единогласному решению всех членов комитета и обладал очень широкими полномочиями. Ему передавались все функции комитета и все его права, кроме перечисленных выше. Одновременно с членом-распорядителем комитет избирал его заместителя, к которому переходили все права руководителя в случае ареста последнего. В случае провала всех членов комитета или даже организации в целом право кооптации нового состава комитета переходило не к ЦК партии, а к ее заграничному представителю.
Во втором пункте устава подчеркивалось, что Боевая организация пользуется полной технической и организационной самостоятельностью, имеет свою кассу и связана с партией через посредство Центрального Комитета. Сношения ЦК и Боевой организации должны были осуществляться через особого уполномоченного, избранного комитетом из числа ее членов. ЦК определял круг лиц, против которых направлялась деятельность Боевой организации, и момент полного или временного прекращения террористической борьбы. Однако при этом в уставе делалась оговорка, что в случае принятия ЦК такого решения за Боевой организацией остается право довести до конца террористические акты, подготовленные до постановления, и лишить ее этого права может только съезд партии эсеров132
. Таким образом, Боевая организация была автономной единицей, почти независимой от партии.Создание Боевой организации в условиях нараставшего революционного подъема привело к усилению индивидуального террора. В конце 1904 г. эсеры приняли решение о покушении на великих князей Сергея Александровича и Владимира Александровича, петербургского генерал-губернатора Трепова и киевского генерал-губернатора Клейгельса. 4 февраля 1905 г. бывший член «Петербургского союза борьбы за освобождение рабочего класса», участник покушения на Плеве И. П. Каляев бросил в Кремле бомбу в карету московского генерал-губернатора великого князя Сергея Александровича, который был убит. Обличительная речь И. П. Каляева на суде прозвучала на всю Россию.
Так начался для партии эсеров 1905 г. Ее позиция во время первой русской революции отличалась крайней шаткостью и неустойчивостью. С одной стороны, партия активизировала террористическую деятельность. В осуществлении террористических актов кроме Боевой организации участвовали боевые дружины, созданные при Белостокском, Волынском, Двинском, Витебском, Одесском, Гомельском, Красноярском, Уфимском, Нижегородском, Московском и Тифлисском комитетах социалистов-революционеров. В Нижнем Новгороде был убит начальник охранного отделения, в Уфе — губернатор, в Москве — градоначальник. Всего, по данным жандармерии, местными боевыми дружинами в течение 1905 г. было совершено более 30 покушений.
Полагая, что уже наступило время для «введения социализма» в деревне, эсеры призывали крестьян к борьбе с помещиками. Газета «Революционная Россия» в мае 1905 г. рекомендовала крестьянству захватывать и распахивать миром поля, организованно пользоваться казенными, удельными, помещичьими лугами и лесами, изгонять представителей власти. При захвате земли предлагалось уничтожать межи, границы частных владений и документы на владение землей, объявлять ее общей собственностью и уравнительно разверстывать между трудящимися.