Среди важнейших событий, которыми было отмечено патриаршество Святейшего Алексия II, митрополит Кирилл назвал восстановление общения Церкви в зарубежье с Церковью в отечестве:
Несмотря на полное разрушение церковной благотворительности в советское время, к 2008 году созданы и успешно действуют церковные приюты, клиники, службы помощи больным и бездомным, реабилитационные центры, школы и курсы сестер милосердия, благотворительные столовые, другие социальные учреждения. На протяжении 20 лет были канонизированы более 1700 святых.
После распада СССР и падения «железного занавеса» начала увеличиваться диаспора Московского Патриархата, к 2008 году в 51 стране мира действовало более 330 приходов и монастырей Московского Патриархата. Говоря о нерешенных задачах, митрополит Кирилл обратил внимание на преподавание основ православной культуры в школах, необходимость укреплять взаимодействие Церкви с научным и культурным сообществами. Характеризуя церковно-государственные отношения, Владыка призвал сочетать взаимное невмешательство в дела друг друга с широким партнерством Церкви и государства в различных общественно значимых областях. Митрополит дал характеристику межправославным и межхристианским контактам Русской Православной Церкви в период патриаршества Алексия II.
После доклада Местоблюстителя члены Собора приступили к обсуждению процедуры избрания Патриарха Московского и всея Руси. Устав Русской Церкви предусматривал возможность выдвижения Поместным Собором дополнительных кандидатов на Патриарший Престол. Однако по предложению митрополита Донецкого и Мариупольского Илариона (Шукало) Поместный Собор отказался от выдвижения дополнительных кандидатур. Предложение архиепископа Полоцкого и Глубокского Феодосия (Бильченко) об избрании Патриарха жребием было отклонено, Собор высказался за избрание Патриарха тайным голосованием.
На втором пленарном заседании выступил митрополит Киевский и всея Украины Владимир, который рассказал о современном состоянии церковной жизни на Украине и пожелал, чтобы жребий патриаршего служения выпал митрополиту Кириллу. Это заявление главы Украинской Православной Церкви в значительной степени предопределило позицию делегатов от Украины, которые составляли более четверти общего числа делегатов.
Митрополит Минский и Слуцкий Филарет заявил, что снимает свою кандидатуру в пользу Патриаршего Местоблюстителя. Глава Белорусского Экзархата подчеркнул, что Церковь должна консолидироваться вокруг единого кандидата.
Голосование на выборах Предстоятеля Русской Православной Церкви. 27 января 2009 г.
После этого делегатам Собора были розданы бюллетени, включавшие два имени — митрополита Кирилла и митрополита Климента. Голосование началось около 6 часов вечера. Лишь около 10 часов вечера председатель Счетной комиссии объявил результаты голосования. Согласно его докладу, в голосовании приняли участие 702 делегата Собора. Двое делегатов не опустили бюллетени в урны. Количество вынутых из урн бюллетеней — 700, из них действительных 677, недействительных — 23. По итогам голосования Местоблюститель Патриаршего Престола митрополит Кирилл получил 508 голосов, управляющий делами Московской Патриархии митрополит Климент — 169 голосов. Участники Собора встретили известие об избрании митрополита Кирилла на Патриарший Престол аплодисментами.
Благодарственный молебен после избрания митрополита Кирилла на Патриарший Престол. 27 января 2009 г.