С сентября 1923 г. Политуправление РВСР стало именоваться Политическим управлением (ПУ) РВС СССР. 28 марта 1924 г. (приказ РВС СССР № 446/96), в связи с общей реорганизацией центрального аппарата, Политуправление РВС СССР переименовано в Политуправление РККА и подчинено Наркому по военным и морским делам.
Директивой РВС СССР № 4763/51008 от 12 января 1925 г. и приказом № 234 от 2 марта 1925 г. в Красной Армии вводилось единоначалие для командного состава – членов партии, имеющего опыт партийно-политического руководства, и начсостава центрального аппарата. Ему по штату был положен помощник по политической части. При беспартийных командирах частей и соединений военные комиссары оставались, но освобождались от повседневного контроля над строевой и административно-хозяйственной деятельностью. На них возлагались функции партийно-политического руководства и ответственность за морально-политическое состояние части.
В последующие годы командиров коммунистов становилось все больше, а комиссаров все меньше. К 1928 году постепенно в армии было введено единоначалие. Комиссары были заменены на помощников командира по политической части.
Институт военных комиссаров с прежними обязанностями контроля сохранялся в Военно-Морском флоте и национальных формированиях в силу специфики их работы. В ВМФ служили все, практически сто процентов, офицеры и адмиралы царского флота. Их не заменишь коммунистом – матросом. Здесь знания нужны: как управлять кораблем или соединением кораблей, или руководить в штабе флота. Это не шашкой размахивать. Приказом РВС СССР № 800 от 30 июля 1925 г. было объявлено Временное положение о военных комиссарах армии и флота и помощниках командиров по политчасти, регламентирующее их функции и обязанности. Оно было отменено приказом РВС СССР № 385 от 24 ноября 1928 г., вводившим в действие Положение о комиссарах, командирах-единоначальниках и помощниках по политической части (для мирного периода). Положение уточняло и дифференцировало задачи и функции: а) военных комиссаров, которые назначались при беспартийных командирах, возглавляли политический аппарат частей и соединений и освобождались от контроля и подписания приказов, не относящихся к вопросам партийно-политической работы; б) командиров-единоначальников, сосредоточивающих в своих руках вопросы оперативно-строевые, административно-хозяйственные и осуществлявших партийно-политическое руководство через своих помощников по политической части; в) помощников по политчасти, непосредственно руководивших партийно-политической работой в части.
Вот решение о единоначалии в армии.