После общего разговора радушных хозяев традиционно следовала экскурсия на второй этаж, в домовую церковь. Идея ее интерьеров была подсмотрена архитектором в домовой церкви князя Голицына в Петербурге. 2 сентября 1836 года в университетскую церковь сразу же повели императора Николая I, а 3 июля 1837 года – его сына Александра II. Храм очень понравился августейшим персонам таинственным освещением сверху. Сегодня в этом помещении разместился музей истории университета. На самом почетном месте посетитель может видеть последнюю страницу указа об открытии вуза с автографом императора Александра I. Это подлинник документа.
Домовая церковь (музей университета) – самое подходящее место для рассказа о религиозном воспитании студентов, которое из Казани распространилось на всю Россию и закончилось громким конфузом.
В 1819 году в Казанский университет прибыл 41-летний ревизор Михаил Магницкий. Через шесть дней ревизии он нашел в списках почетных членов Казанского университета французского революционера – аббата Анри Грегуара, депутата французского Конвента, сторонника суда над королем Людовиком XVI. Магницкий увидел в этом доказательство революционного духа, овладевшего Казанским университетом. Заодно ревизор обвинил руководство вуза в безбожии и растрате казённых денег.
Вернувшись в Петербург, чиновник предложил публично разрушить здание университета. Александр I возразил: «Зачем разрушать, можно исправить» и отправил его устранять недостатки. Специально для Магницкого и с его участием в 1820 году была разработана подробная инструкция, которая позже применялась и к другим университетам России.
Инструкция указывала, что преподаватели философии должны руководствоваться в своем курсе лекций посланиями апостола Павла, что основы политических наук следует извлекать из творений Моисея, Давида и Соломона и только в случае недостаточности – из сочинений Аристотеля и Платона. Преподаватель всеобщей истории должен был доказывать, что все человечество произошло от Адама и Евы. Профессор физики был обязан указывать на премудрость Божию и ограниченность познания окружающего мира.
Одиннадцать профессоров, непреклонных к мракобесию, Магницкий уволил, заявив об их неблагонадежности. Напуганные преподаватели начали нести мракобесную галиматью. Например, заявляя на лекциях, что гипотенуза в прямоугольном треугольнике служит доказательством Бога. Это, мол, «соединение горнего с дольним».
Теперь в вузе должны были подбирать штат «богобоязненных» студентов, которые обязаны были следить за товарищами. Студенты общежития делились не по факультетам или курсам, а по степени своей нравственности. Каждая степень жила и обедала отдельно, чтобы «порочные» не могли заражать «безвинных». Если студент плохо подготовился к семинару, он назывался «грешным» и его сажали в карцер. Окна и дверь этой комнаты были зарешечены, над входом виднелась надпись из Библии; на одной стене карцера висело распятие, на другой – картина Страшного суда, к которому неуч должен был готовиться. Студента вводили в карцер в крестьянском армяке – долгополом халате из грубой, ткани, с капюшоном, без пуговиц и застёжек, на ремне. На ноги лодыря одевали лапти – крестьянскую обувь из коры деревьев, крепившуюся на ноге шнурками тоже из коры деревьев.
Пока «грешник» исправлялся, сокурсники перед началом лекций должны были молиться за него. Карцер ежедневно посещал священник, который после раскаяния исповедовал неуча и причащал его.
Кампания по нравственному исправлению студентов закончилась 13 декабря 1826 года, когда фельдъегерь привез в Казань приказ об аресте Магницкого за «…вредные внушения, …связи с людьми предосудительной нравственности и поведения… бывшим казанским прокурором Херувимовым, Губовым и Уманцем». Ревизора обвинили в еще больших хищениях, чем те, что ранее он обнаружил. И конфисковали его имущество.
Наверняка, в едва открывшейся церкви студенты благодарили Бога за избавление университета от лицемера и авантюриста всероссийского масштаба.
После посещения университетской церкви с необычным светом гостей привычно вели в соседний актовый зал для представления преподавателей – научных светил и их студентов. Уже после путешествия Дюма в этом зале случилось чрезвычайное происшествие, вошедшее в историю.
Накануне, в ноябре 1887 года произошло столкновение студентов Московского университета с полицией. Два студента были убиты. Более 350 казанских студентов в полдень 16 декабря 1887 года собрались в актовом зале, чтобы выразить солидарность с московскими коллегами. За ними с угрозами вошел инспектор Потапов – главный надзиратель за благонадежностью студентов. Но от одного из подопечных он получил пощечину и был изгнан из зала.
В 12.30 в сопровождении группы преподавателей вошел 65-летний ректор Николай Кремлев, который долго призывал студентов разойтись. В 15.45 студенты ушли. 99 из них в знак протеста бросили перед кафедрой свои студенческие билеты. Среди них был и брат повешенного террориста, будущий лидер большевиков Владимир Ульянов, взявший псевдоним «Ленин».