Версия террористического акта возникла очень быстро и сразу же завоевала статус «версии номер один», которую никто из официальных лиц ни разу не подверг сомнению. Для «Российских железных дорог» версия теракта оказалась самой выгодной и удобной, ибо она снимает с компании проблему ответственности за неудовлетворительное техническое состояние путей и подвижного состава. Как говорится, «война все спишет». Предположение, что имела место техногенная катастрофа, президент «Российских железных дорог» Владимир Якунин назвал
«Возможно, что просто не выдержал нагрузки рельс, особенно после прохода незадолго перед этим скоростного поезда „Сапсан“. Ведь практически никто не обратил внимания на тот факт, что окончательная скорость „Сапсана“ — он шел до поезда № 166 — значительно расходится с той, которая была заявлена при его закладке, — поделился своими размышлениями компетентный источник. — Ограничению она подверглась именно из-за ненадлежащего для столь высоких скоростей состояния полотна и контактной сети. Характер повреждения торцов двух вагонов также вызывает некоторое недоумение, ведь фактически получается, что один вагон „наскочил“ на другой».
Прежде всего, совершенно непонятна логика террористического акта (если это был действительно он). Против кого он был направлен?.. Рассчитать, что жертвами крушения «Невского экспресса» станут именно главы «Росавтодора» Сергей Тарасов и «Росрезерва» Борис Евстратиков, было невозможно. У погибших чиновников имелись очень большие шансы выжить, их гибель — роковое стечение обстоятельств, а не результат покушения. Последний вагон, в котором ехали высокопоставленные чиновники, располагался дальше всех остальных от эпицентра взрыва, и теоретически его пассажиры вообще не должны были пострадать. Но машинист, как требует инструкция, применил экстренное торможение, из-за чего хвостовая часть состава начала «складываться». Первые десять вагонов устояли на рельсах, и их пассажиры не пострадали. Хвостовые вагоны с номерами 2, 3 и 4 опрокинулись, а самый «несчастливый» последний вагон буквально взмыл в воздух, снес бетонные электроопоры и ударился об откос тамбуром. Такой сценарий совершенно не мог быть запланированным.
Прозвучал ряд предположений, что, например, теракт должен был продемонстрировать «силовикам» в Правительстве России опасность ограничения влияния «либералов», что взрыв «Невского экспресса» должен стать сигналом к передачи власти подобно тому, как взрывы домов 1999 года стали сигналом к уходу Бориса Ельцина… Говорили, что это — начало новой волны терроризма, всплеска ксенофобии и нетерпимости. Но все это — дутая конспирология, бесплодные игры ума. А тем временем английский