18 ноября лодка покинула Адмиралтейский завод и за двумя ледоколами начала движение в Кронштадт. При этом караван был обнаружен и обстрелян противником, ледокол «Молотов» был вынужден отдать буксир, и остаток пути лодка прошла своим ходом. В Кронштадте на нее были приняты усиленные запасы топлива, масла, продовольствия и боеприпасов. В командование лодкой вступил комдив В. А. Егоров. Помимо экипажа в походе должны были принять участие сам М. А. Рудницкий и шесть рабочих.
В ночь на 22 ноября «К-51» за ледоколом «Ермак» начала переход к острову Лавенсари. Как назло, в этот день началась кратковременная оттепель с сильным ветром, сопровождавшаяся подвижкой и торошением льдов. На переходе лодку неоднократно затирало, и «Ермаку» приходилось возвращаться, чтобы освободить ее из ледового плена. Однажды льды так сильно сдавили корпус корабля, что кормовая часть ушла в воду, и через газоотводы оказались залиты все дизели и трюм 5-го отсека. Еще более неприятный случай произошел утром в районе острова Сескар. Льды загнали лодку на глубину 3 м, и их нагромождение на надстройке и мостике привело к массовым поломкам расположенных там устройств. Не считая многочисленных деформаций легкого корпуса и ограждения рубки, вышли из строя обе 100-мм пушки, была нарушена герметичность цистерн главного балласта № 1 и № 2, погнуто перо носовых горизонтальных рулей, порваны антенны. Днем лодка достигла Лавенсари, где экипаж в течение двух суток пытался устранить полученные повреждения. Днем 24 – го было проведено первое с начала подготовки к походу пробное погружение. Оно сразу показало, что корабль перегружен на 60 т. Два дня экипаж пытался устранить недостатки, но безрезультатно. Капитан «Ермака» заявил, что угля осталось только на обратный переход до Кронштадта. Поскольку к тому времени стало очевидно, что восстановить боеспособность подлодки можно только в заводских условиях, командование КБФ дало разрешение на возвращение. 30 декабря «К-51» прибыла в Ленинград и встала на зимовку в торговом порту.
На Ладожском озере зима 1941 г. началась очень рано и была на редкость суровой. 7 ноября рейд порта Осиновец в Шлиссельбургской губе был скован первыми льдами. Из-за сильного похолодания в середине ноября ледовая обстановка ухудшалась с каждым днем. Приближался полный ледостав, рейды замерзли. Командование приняло решение о зимней дислокации флотилии на западном побережье в районе Осиновец-Морье.
В районах маяка Сухо, мыса Пайгач, маяков Кареджи и Осиновец толщина льда 17 ноября достигала 15–20 см, появились торосы, трудно преодолеваемые кораблями. В Воховской губе высота торосов доходила до 2 м.
В этот день из Новой Ладоги вышел эшелон судов в составе сторожевого корабля «Пурга», канонерской лодки «Селемджа» с катерами «МО-216» и «МО-175» и канонерской лодки «Нора» с баржей и бронекатерами «БКА-99» и «БКА-100». В голове колонны шла канонерская лодки «Бира», которая выполняла роль ледокола. Все корабли имели полный запас топлива, боеприпасов и трехмесячную норму продовольствия, на случай если придется зимовать во льдах. Переход совершался в тяжелых ледовых условиях. На преодоление 60-мильного пути корабли потратили четверо суток. 18 ноября «БКА-99» получил большую пробоину, машинный отсек заполнился водой, но ценой больших усилий экипажа катер удалось спасти. 20 ноября на подходе к бухте Морье катер «МО-216» был раздавлен льдом и затонул. Личный состав и вооружение с него успели снять на канлодку. 21 ноября корабли вошли в бухту Морье.
27 ноября последний отряд с грузом продовольствия и боеприпасов для Ленинграда в составе канонерской лодки «Бира» транспортов «Чапаев», «Вильсанди», 11 тральщиков вышел из Новой Ладоги в Осиновец. Уже действовала автомобильная дорога, автомашины и корабли шли параллельными курсами. Тяжелые льды сжимали корпуса кораблей, трещали обшивка и шпангоуты, от ударов о льдины гнулись и ломались винты.
Из-за тяжелых льдов и сильного шторма переход затянулся и обычной скудной нормы топлива транспорту «Вильсанди» не хватило, чтобы дойти до порта назначения. Кочегары забросили в топки последние лопаты угля, когда до восточного берега оставалось еще миль 5–7, пар садился. На счастье ветер дул с норд-оста. Сильным шквалистым ветром и льдами транспорт несло к бухте Морье, и если бы не береговой ледяной припай, то «Вильсанди», уже лишенного хода, выбросило бы на берег. Но его вместе со льдом поднесло к припаю постепенно ледяная шуга уплотнялась, и наконец судно остановилось и тут же вмерзло в лед у самого берега, несколько севернее бухты Морье. Остальные корабли и суда, участвовавшие в этом походе, 4 декабря шторм «расставил» в беспорядке вокруг на зимовку. Переход продолжался семь дней вместо обычных 15 часов по чистой воде.