Свое состояние Александр Онищенко, как и многие украинские олигархи, сделал в газовом бизнесе. В 1990-х годах он был трейдером, продававшим природный газ из Туркмении. В 2000-х создал несколько компаний, добывающих газ в самой Украине. Именно это легло в основу уголовного дела против него. Правоохранители обвиняют олигарха в создании коррупционной схемы, в результате которой пострадало государственное газодобывающее предприятие.
По словам полицейских и прокуроров, компании Онищенко работали по договорам совместной деятельности с правительством, однако добытый на переданных им скважинах газ продавали по бросовым ценам подконтрольным олигарху фирмам, после чего он реализовывался на рынке уже за полную стоимость. Кроме того, эти компании уклонялись от уплаты налогов. Общий ущерб для государства прокуратура Украины оценила в 3 млрд гривен (около 100 млн фунтов стерлингов). Она выдала ордеры на арест олигарха, а также более 20 человек, якобы причастных к этому делу, в том числе 70-летней матери Онищенко Инессы.
Однако сам господин Онищенко, который успел уехать в Великобританию и попросить там политического убежища, утверждает, что выдвинутые против него обвинения не имеют ничего общего с борьбой с коррупцией, а жертвой коррупции и рейдерства стал он сам. По его словам, совместные с государством компании действительно использовали теневые схемы, однако все это делалось с ведома киевских властей, и украинские чиновники получали от него большие откаты. Так, при бывшем президенте Януковиче Онищенко отдавал его представителям ровно половину полученной прибыли. С победой «революции достоинства» на Майдане новые власти стали требовать от него еще больше.
Онищенко говорит, что познакомился с Порошенко в 2012 году, когда они оба были депутатами Верховной рады. Олигарх даже назвал место их регулярных встреч – ресторан «Царское село» в Киеве, где они обсуждали намерения Порошенко создать свою парламентскую группу. После свержения Януковича в феврале 2014 года Порошенко выдвинул свою кандидатуру на выборах президента Украины и обратился к Онищенко с личной просьбой выделить деньги на избирательную кампанию, а взамен пообещал в случае своего избрания на пост главы государства назначить подконтрольных Онищенко людей в руководство государственного предприятия «Укргаздобыча». Онищенко, по его словам, выделил Порошенко 10 млн долларов, которые передал через «кассира» нынешнего президента Давида Жванию. Однако после своего избрания Порошенко обещание не выполнил, сославшись на то, что «Укргаздобычу» контролировал Арсений Яценюк – на тот момент премьер-министр Украины.
Тогда же Порошенко попросил Онищенко выкупить для него газодобывающие компании, принадлежавшие ныне скрывающемуся в Израиле бывшему министру энергетики в правительстве Януковича Эдуарду Ставицкому и сыну бывшего премьер-министра Николая Азарова, которых, со слов Порошенко, «все равно будут глушить». Онищенко выполнил эту просьбу, и в дальнейшем, будучи уже президентом, Порошенко вел себя как владелец этих компаний, давая Онищенко указания о распределении доходов от их деятельности. Олигарха постоянно вызывали в администрацию президента, и в ходе личных встреч Порошенко рисовал схемы зарабатывания для него денег. В частности, газодобывающие компании Онищенко поставляли газ предприятиям, на которые указывали Порошенко и Игорь Кононенко (украинские журналисты называют этого бизнесмена «кошельком» президента). Кононенко назначал в руководство государственных энергетических компаний своих людей, и, как следствие, фирмы Онищенко выигрывали тендеры на поставку газа по максимальной цене. Кононенко лично считал весь объем поставленного газа и сумму выплат за него и забирал у Онищенко всю прибыль – по две тысячи гривен за тысячу кубометров газа. Кроме того, каждый месяц он приезжал в офис к Онищенко и увозил по миллиону долларов наличными «на карманные расходы».
Онищенко утверждает, что президент Украины широко использует «грязные» деньги для политических манипуляций. Так, в конце 2015 года Порошенко поставил перед ним задачу финансировать информационную войну против премьер-министра Арсения Яценюка, мешавшего его бизнес-интересам. Олигарх говорит, что участвовал в этой кампании совместно с одним из лидеров парламентской оппозиции, бывшим руководителем канцелярии Януковича Сергеем Левочкиным, а также ультранационалистической партией «Свобода» и другими маргиналами. Ежемесячно Онищенко выделял на кампанию против Яценюка 3 млн долларов, в том числе до 200 тыс. долларов «Свободе» на проведение антиправительственных акций и 100 тыс. на протестные митинги лидера «Партии простых людей» Сергея Каплина. Он также стоял за громким обвинением в создании коррупционных схем, выдвинутым Яценюку начальником государственной финансовой инспекции Николаем Гордиенко.