На базе Министерства госбезопасности и Министерства внутренних дел, как и в довоенный период, создавалось единое Министерство внутренних дел СССР, которое возглавил маршал Советского Союза Лаврентий Павлович Берия, а его первыми заместителями были утверждены генерал-полковники Богдан Захарович Кобулов и Сергей Никифорович Круглов. Хорошо известно, что предложение о назначении Л. П. Берии на пост главы объединенного МВД СССР внес глава правительства Г. М. Маленков, однако сами обстоятельства принятия этого решения вызвали полемику в литературе. Традиционная точка зрения, представленная в работах большинства историков, состоит в том, что это была личная инициатива «лубянского маршала», который на новом посту получил мощный инструмент в борьбе за единоличную власть и реализацию своего проекта «реформ». Однако ряд мемуаристов и публицистов (С. Л. Берия, Б. В. Соколов[208]
) высказали экзотическую версию, что Л. П. Берия с большой неохотой согласился вернуться в МВД, рассчитывая посадить в расстрельное кресло министра С. А. Гоглидзе или В. С. Рясного, и его пришлось чуть ли не упрашивать, в том числе лично Н. С. Хрущеву, занять этот пост. Хотя в самих хрущевских мемуарах как раз содержится традиционная версия этого события[209]. Наконец, необходимо подчеркнуть другой немаловажный факт, на который обычно не очень обращают внимание многие историки: еще одним первым заместителем главы МВД СССР был переназначен генерал-полковник Иван Александрович Серов, занимавший эту должность с февраля 1947 года. А как известно, еще с довоенных времен, в бытность главой НКВД УССР, И. А. Серов особо сблизился с Н. С. Хрущевым, а в годы войны и с маршалом Г. К. Жуковым, в бытность того командующим 1-м Белорусским фронтом, а затем и главой Советской военной администрации в Германии, у которого он был заместителем и уполномоченным НКВД СССР.На базе Военного и Военно-Морского министерств также создавалось единое Министерство обороны СССР, руководителем которого был назначен маршал Советского Союза Николай Александрович Булганин, а его первыми заместителями — еще два маршала Советского Союза: Александр Михайлович Василевский и Георгий Константинович Жуков. Министерство иностранных дел СССР вторично возглавил Вячеслав Михайлович Молотов, первыми заместителями которого были утверждены Андрей Януарьевич Вышинский и Яков Александрович Малик. Наиболее важные отраслевые ведомства, которые были существенно укрупнены — Министерство внутренней и внешней торговли, Министерство машиностроения, Министерство транспортного и тяжелого машиностроения и Министерство электростанций и электропромышленности СССР, — возглавили многоопытные и проверенные сталинские управленцы: Анастас Иванович Микоян, Максим Захарович Сабуров, Вячеслав Александрович Малышев и Михаил Георгиевич Первухин. При этом двое первых сохранили прежний статус заместителей председателя Совета Министров СССР, а вторые потеряли его. Кроме того, вместо М. З. Сабурова новым председателем Госплана СССР был назначен его первый заместитель Григорий Петрович Косяченко.
В развитие реформы Президиума ЦК было принято решение сократить количество кандидатов в члены этого высшего партийного ареопага с 11 до 4. Причем все прежние кандидаты в члены были «выведены за штат», а новые набраны из числа трех прежних полноправных членов Президиума ЦК: председателя Президиума Верховного Совета СССР Николая Михайловича Шверника, заместителя председателя Совета Министров СССР Пантелеймона Кондратьевича Пономаренко и Первого секретаря ЦК КП Украины Леонида Георгиевича Мельникова, а также давнего бериевского соратника, Первого секретаря ЦК КП Азербайджана Джафара Аббасовича Багирова, ранее вообще не входившего в состав Президиума ЦК.