Третье отделение превратилось в орган верховной власти, сосредоточившей в своих руках почти все ветви управления государством и, по-существу, подменяющий несколько министерств. Подчиняясь только Николаю I, третье отделение стояло вне общей системы государственных учреждений, находясь над ними. Министры должны были выполнить все его указания по поводу непорядков и злоупотреблений в из ведомствах. Генерал – губернаторы и губернаторы доносили по проблемам, входившим в сферу деятельности Третьего отделения, но Министерству внутренних дел, которому подчинялись, а непосредственно императору через начальника Отделения.
Третьим отделением руководил главноуправляющий, он же шеф жандармов, и управляющий, он же начальник штаба корпуса жандармов. Исполнительными органами Третьего отделения были учреждения и воинские части жандармерии.
Аппарат Отделения состоял из пяти экспедиций, общего архива, двух секретных архивов, типографии. Первая секретная экспедиция ведала всеми политическими делами – наблюдением за революционными и общественными организациями и деятелями. Она проводила дознания по политическим делам, составила для императора ежегодник «Отчеты о действиях» – обзоры общественного мнения и политической жизни страны, вела дела, связанные с оскорблением царя и императорской фамилии. Вторая экспедиция вела надзор за религиозными сектами, собирала сведения об изобретениях, фальшивомонетчиках, заведовала Петропавловской и Шлиссельбургской крепостями – тюрьмами, штатами Отделениями. Третья экспедиция вела наблюдение за проживавшими в России иностранцами, собирала сведения о политическом положении, революционных партиях и организациях зарубежных государств. Четвертая экспедиция собирала сведения о крестьянском движении и о мероприятиях правительства по крестьянским проблемам, о всех происшествиях в стране, о видах на урожай. Пятая экспедиция ведала цензурой и наблюдала за прессой. При необходимости Отделение создавало специальные комиссии и комитеты. Его личный состав был небольшой – шестнадцать человек в 1826 году, сорок человек – в 1855 году. Возглавляли Третье отделение и Корпус жандармов А. Х. Бенкендорф (1826–1844), А. Ф. Орлов (1844–1856), В. А. Долгоруков (1856–1866), П. А. Шувалов (1866–1874), А. Л. Потапов (1874–1877), Н.В, Мезенцев (1877–1878), А.Р. Дрентельн (1878–1880).
Свое царствование Николай I начал с того, что выдвинул жесткие требования дисциплины и порядка. Началось настойчивое насаждение в стране послушания и всеобщего страха. Выбранные средства, естественно, быстро привели к всеобщему отупению бюрократии. Великий русский поэт А.С. Пушкин заявил своему приятелю, хвалившему Николая I: “Хорош, хорош, только на тридцать лет дураков наготовил». Позже Пушкин добавил: «Догадал же меня черт родиться с умом и талантом в России».
К страху чиновники и подданные быстро привыкли – это стало нормальным состоянием империи. Начальник политической полиции А.Х Бенкендорф докладывал царю: «Все ждут если и не полного преобразования, то хотя бы исправления в порядке управления». Его заместитель М. Фок добавлял: «Теперь самое время приступить к реформам в судебном и административном ведомствах, не действуя, впрочем, слишком решительно. Это ожидают с величайшим нетерпением, и все в один голос твердят об этом».
Прочитав доклады Третьего отделения, Николай I вернул из ссылки М. Сперанского. За пять лет реформатор подал царю «Заметки по организации судебной системы в России», «Положение о порядке производства в чины», «Проект учреждения уездного управления», «Записка об устройстве городов», «Проект учреждения для управления губернией». М. Сперанский доработал «Введение к Уложению государственных законов» – реформу государственного управления и общественного строя. Само собой, ни один из новых законов не был принят. Николай I приказывал М. Сперанскому: «Цель вашей работы заключается не в полном изменении существующего порядка управления, но в его усовершенствовании посредством некоторых частных перемен и дополнений».
Чиновники сцепились с реформаторами. Половинчатые изменения в управлении страной готовились в секретных комитетах. Ни о каком гражданском обществе не было и речи – император не доверял своим подданным после восстания декабристов. Высшие чиновники, как обычно, заявляли, что лучше всех знают, что необходимо стране и народу. В результате «горы рождали мышей». Разработка законов об улучшении жизни подданных поручались чиновникам, живших за их счет. В Государственный совет на обсуждение подавались заведомо ложные документы, извращавшие ситуацию в стране. Шли игра в реформы. Николай I усилил жандармерию, но систему набора и назначения на государственную службу, конечно, не изменил.