В 1842 – 1843 годах Шамиль даже завел себе артиллерию, частью набранную из трофейных пушек, а частично изготовленную на его собственном заводе в Ведено. Впрочем, из 50 отлитых там стволов оказались годными в дело чуть больше десятка.
Весь мусульманский Кавказ был обложен закятом – десятой частью дохода с хлеба, овец и денег – и хараджем – податью с горных пастбищ и с некоторых селений. Точный доход Шамиля не известен, но это была весьма значительная сумма.
Северокавказский имамат просуществовал в общей сложности 30 лет. Помимо хорошо поставленного сбора налогов, там был свой диван, некое подобие парламента, система наказаний – от штрафа и знаков позора до смертной казни или ссылки в «аул без солнца» – Четль в горном Дагестане, система наград: в начале 1840-х годов появились даже медали, представлявшие собой серебряные или позолоченные бляхи различной формы, носившиеся на черкеске.
Необходимо отметить, что Шамиль немало внимания уделял и развитию образования, и по его приказу в каждом ауле должно было быть медресе.
В 1837 году на Кавказ прибыл император Николай I и остался весьма недоволен сложившимся положением. Барон Розен был снят, а его место занял генерал Головин. В следующем году на черноморском побережье были выстроены укрепления Навагинское, Вельяминовское и Тенгинское, а также начата крепость Новороссийская. В 1839 году начались активные боевые действия по вытеснению армии Шамиля в горы. Отряд под командованием генерала Граббе двинулся против главных сил Шамиля, укрепившихся у села Аргвани. Шамиль, потерпев поражение, был вынужден уйти в дагестанский аул Ахульго, который представлял собой труднодоступную горную крепость, стоявшую на склонах с крутизной до 50 градусов и высотой более 100 метров. Только с пятого раза и с большими потерями, составлявшими около двух с половиной тысяч воинов, крепость была взята, но Шамиль, сумев прорваться через окружение, ушел в Чечню. Там он через три года поднял новое восстание.
В начале февраля 1840 года горцы овладели причерноморским фортом Лазарев и истребили всех его защитников, 29 февраля ими было взято укрепление Вельяминовское, а 23 марта укрепление Михайловское. Остаток гарнизона Михайловского, поняв, что мюриды уже в крепости, взорвал пороховой погреб, погибнув вместе с захватчиками.
2 апреля Шамилем был взят Николаевский форт, но форты Навагинский и укрепления Абинского выстояли.
Русские войска занялись поголовным разоружением чеченцев, что вызвало крайнее озлобление населения и сыграло на руку Шамилю, который в это время завоевал Салатавию и вторгся в Аварию. К осени уже вся Чечня снова была на стороне Шамиля, и он распространил свои набеги до Терека и чуть не овладел Моздоком.
Весною 1842 года Шамиль безуспешно пытался взволновать южный Дагестан, а генерал Граббе попытался в это время овладеть резиденцией Шамиля, аулом Дарго. Поход оказался неудачным, и было потеряно около 60 офицеров и 1700 нижних чинов.
Военный министр Чернышев, будучи на Кавказе и увидев возвращение отряда Граббе, запретил на 1843 год любые наступательные экспедиции. Бездействие войск ободрило мюридов, и набеги участились. Связи между регионами Кавказа были практически прерваны, несколько укреплений пали.
В конце 1844 года был назначен новый главнокомандующий на Кавказе, граф М. С. Воронцов. В июне 1845-го он двинулся с большим отрядом в Андию и затем к резиденции Шамиля – Дарго. Дарго был взят, но потери превышали разумные пределы.
В Чечне началась массовая вырубка лесов, сопровождаемая постоянными стычками в разных местах региона.
Слухи, разнесшиеся в 1853 году о предстоящем разрыве отношений России с Турцией, вновь активизировали горцев, но пара набегов окончилась неудачами, и энтузиазм пропал. Шамиль стал заставлять горцев воевать под угрозой жестоких наказаний.
В 1854 году начальник турецкой анатолийской армии предложил Шамилю двинуться на соединение с ним со стороны Дагестана, и в конце июня тот вошел в Кахетию, но, узнав о приближении русских войск, горцы обратились в бегство.
В начале 1855 года главнокомандующим на Кавказе был назначен генерал Н. И. Муравьев, а весною 1856 года, после заключения мира с Турцией, было решено начать окончательное завоевание Кавказа.
Войска Шамиля стали вытесняться, и он сначала бежал в Аргунское ущелье, а потом в Ведень – свою новую резиденцию. Но 1 апреля 1859 года она была взята штурмом.
Шамиль двинулся за Андийское Койсу, Чечня была усмирена. Шамиль, поселившийся в ауле Карата, укрепил гору Килитль, а правый берег Андийского Койсу, против Конхидатля, покрыл сплошными каменными завалами, вверив их оборону своему сыну Кази-Магоме. Но ему во фланг вышел дагестанский отряд, и Шамиль бежал на гору Гуниб. С ним оставалось 332 фанатичных мюрида. В августе 1859 года Гуниб был осажден, и князь Барятинский, российский главнокомандующий, начал вести с Шамилем переговоры. 25 августа произошло взятие Гуниба и почетное пленение Шамиля.
В начале 1860 года в усмиренной, вроде бы, Чечне снова вспыхнуло восстание, подавление которого затянулось до конца следующего года.