Заказчик регистрирует полученный от посредника счет-фактуру в книге покупок и журнале учета полученных счетов-фактур.
Наряду с вышеприведенным посредник формирует отдельный счет-фактуру на сумму своего вознаграждения, который он регистрирует в книге продаж и журнале выставленных счетов-фактур. Полученный от посредника счет-фактуру на сумму посреднического вознаграждения заказчик регистрирует в книге покупок и журнале полученных счетов-фактур.
В случае ввоза товаров с территории Республики Беларусь на территорию Российской Федерации российской организацией, выступающей в роли комиссионера (агента), действующего по договору комиссии (агентскому договору) в интересах налогоплательщика Республики Беларусь, и реализации вышеуказанных товаров налогоплательщикам Российской Федерации косвенные налоги уплачиваются налогоплательщиками Российской Федерации, приобретающими эти товары. При этом комиссионер (агент) выставляет в адрес покупателей счета-фактуры с отражением в них налоговой ставки в размере 0 %, надписью или штампом
Так как плательщиком НДС организация, применяющая упрощенную систему налогообложения, не является, то и счет-фактуру на сумму комиссионного вознаграждения и дополнительной выгоды она оформлять и выставлять на имя заказчика не должна. Это, в частности, подтверждено в письме Минфина России от 05. 05. 2005 № 03-04-11/98.
В то же время, если по условиям договора комиссионер осуществляет продажу товаров от своего имени, он должен от своего имени выставлять счета-фактуры по товарам на имя покупателя. Реквизиты таких счетов-фактур передаются посредником заказчику. Данный порядок в полной мере применяется комиссионерами, применяющими упрощенную систему налогообложения. При этом данный порядок оформления счетов-фактур не приводит к обязанности комиссионера уплачивать в бюджет НДС по товарам, реализуемым заказчиком через посредника. На это особо указано в том же письме Минфина России от 05. 05. 2005 № 03-04-11/98.
В данном случае посредник не должен выставлять счета-фактуры на реализуемые товары (работы, услуги) как от своего имени, так и от имени заказчика.
Если же окажется, что комиссионер выставил счет-фактуру на реализуемые по договору комиссии (поручения, агентирования) товары (работы, услуги), то заказчик обязан согласно п. 5 ст. 173 НК РФ уплатить указанные в счете-фактуре суммы НДС в бюджет.
В соответствии с подпунктом 9 п. 1 ст. 251 НК РФ для целей налогообложения прибыли не учитываются денежные средства и имущество, полученные комиссионером, агентом и (или) поверенным в связи с исполнением обязательств по договору комиссии, агентскому договору или другому аналогичному договору.
По тому же основанию не увеличивают налогооблагаемую базу по налогу на прибыль суммы, полученные посредником в счет возмещения затрат, произведенных за счет комитента, принципала и (или) иного доверителя, если такие затраты не подлежат включению в состав расходов комиссионера, агента и (или) иного поверенного согласно условиям заключенных договоров.
Соответственно в составе признаваемых для целей налогообложения прибыли расходов посредника не учитываются денежные средства и имущество, передаваемые посредником в связи с исполнением им обязательств по договору комиссии, агентскому договору или иному аналогичному договору. Не уменьшают налогооблагаемую базу и средства, полученные посредником в счет оплаты затрат, произведенных посредником за счет заказчика (п. 9 ст. 270 НК РФ).