Он, как и вся его Семья, был очень религиозным человеком и не только ревностно соблюдал православные обряды, но и посещал монастыри, святые места, много жертвовал из своих личных средств на храмы, всемерно содействовал укреплению в стране основ Православия. За время его царствования количество храмов в России увеличилось на 10000, монастырей — на 250, канонизировано 8 святых (1896 г. — святитель Феодосий Черниговский, 1903 г. — преподобный Серафим Саровский, 1909 г. — княгиня Анна Кашинская, 1911 г. — святитель Иоасаф Белгородский, 1913 г. — святитель Гермоген, Патриарх Московский, 1914 г. — святитель Питирим Тамбовский, 1916 г. — святитель Иоанн Тобольский). Примечательно, что кончину протоиерея Иоанна Кронштадтского (И. И. Сергиева), который еще при жизни признавался святым, Государь всенародно отметил рескриптом со словами выражения скорби: «Неисповедимому Промыслу Божию было угодно, чтобы угас светильник Церкви Христовой и молитвенник Земли Русской». Он определенно разделял мнение о необходимости причисления Иоанна Кронштадтского к лику святых, что в дальнейшем и было осуществлено Русской Православной Церковью (в июне 1990 г.)
При нем продолжалось и усиливалось развитие капиталистических отношений. Темпы роста промышленности были наиболее высокими — более 9% в год. Россия постепенно преодолевала отставание в экономическом развитии от США и ведущих западноевропейских стран. Вместе с тем в ней обострялись социальные противоречия, традиционно отсутствовали действенные рычаги сближения и примирения низов и верхов. Толчком к социальному взрыву — революции 1905-1907 гг. явилась череда поражений в Русско-японской войне, к которой Россия оказалась плохо подготовленной. Николай II первым из монархов, государственных деятелей еще в 1898 г. выдвинул светлую общечеловеческую идею разоружения, он понимал характер и опасность войн, однако же решался на них. Вступление в войны, перерастание их в революцию принесло беды России и предопределило гибель Дома Романовых. В ходе революции, 17 октября 1905 г., Николай II издал манифест, бывший первым шагом к конституционной монархии, приведший к созыву Государственной Думы. Под руководством П. А. Столыпина развернулся процесс интенсивной модернизации страны, но его осуществлению мешали силы как справа, так и слева. Император также не оказался в числе его последовательных сторонников. Начавшаяся летом 1914 г. Первая мировая война резко изменила ход событий. Вступление России в нее было чревато страшными, непредсказуемыми последствиями. Николай Александрович, поколебавшись, поддался давлению окружения и ввел Россию в войну в союзе с Англией и Францией против Германии и ее союзников. В 1915-1917 гг. Николай II был Верховным Главнокомандующим всеми сухопутными и морскими силами России. Главным мотивом акта вступления в войну было оказание помощи Сербии. Вслед за первыми успехами в войне последовали тяжелые неудачи. Они усугублялись разлагающими действиями на фронте и в тылу германской агентуры и внутренних экстремистских сил, пока в феврале 1917 г. все не вылилось в новую революцию. 2 (15) марта Николай Романов подписал отречение, но не в пользу сына (при чьем-то опекунстве), а в пользу своего брата Михаила, что само по себе создавало прецедент нарушения права престолонаследия, осложняло положение и в Императорском Доме, и в политической структуре страны в целом. Россия стремительно катилась к хаосу, чем воспользовались экстремисты. Власть в октябре 1917 г. захватили большевики. Судьба Романовых находилась в тесной связи с угрозой установления их власти и дальнейшим реальным приходом к ней. Временное правительство, поддавшись давлению столичного совета, масонов, не решилось выпустить бывшего Царя за рубеж или оставить на свободе в России. На всем протяжении последующей жизни бывший Император вел себя как гражданин своей страны, болея за ее судьбы, но проявляя необычайную скромность. Николай Романов с Семьей в марте 1917 г. был заключен в Александровском дворце Царского Села, а в августе отправлен в Тобольск, помещен в бывший губернаторский дом, откуда в конце апреля 1918 г. был перевезен в Екатеринбург, заключен в особняк инженера Н. Н. Ипатьева и в ночь на 17 июля по тайному распоряжению В. И. Ленина и Я. М. Свердлова убит вместе с членами Семьи и преданными людьми. Его останки, найденные в захоронении под Екатеринбургом, идентифицированы и в июле 1998 г. погребены в Петропавловском соборе Санкт-Петербурга. Канонизирован 1 ноября 1981 г. Русской Православной Церковью Заграницей как святой великомученик Николай, и в августе 2000 г. — Архиерейским Собором Русской Православной Церкви как святой страстотерпец.