В инструкции «тройкам» НКВД для предварительного рассмотрения дел об уголовных и деклассированных элементах, а также о лицах, злостно нарушающих паспортный режим, в союзных республиках (за исключением Украины и Казахстана), в автономных республиках, краях и областях, входящих в состав РСФСР, а также в областях Украинской и Казахской ССР было приказано организовать «тройки» в составе народного комиссара союзной, автономной республики или его заместителя (начальника У НКВД или его заместителя), членов: начальника Управления милиции и начальника соответствующего отдела, чье дело разбирается на «тройке». Участие прокурора в заседании «тройки» было обязательно.
Рассмотрению «троек» подлежали дела о лицах, имевших судимости или приводы за уголовные преступления и не порвавших связи с уголовно-преступной средой; о лицах, и не имеющих судимостей и приводов, но незанятых общественно полезным трудом, не имеющих определенного местожительства и связанных с уголовно-преступной средой, в том числе о всех содержателях притонов и скупщиках краденого; о ворах-рецидивистах, уличенных в конкретных преступлениях, хотя и имеющих определенное местожительство и прикрывающихся работой на предприятиях, заводах, в учреждениях; о хулиганах-рецидивистах, приговаривавшихся ранее судами за хулиганство не менее двух раз к тюремному заключению или к принуд-работам на срок от одного года и более, в случае совершения ими хулиганства, вызывающего необходимость привлечения их снова в уголовном порядке; о нищих-профессионалах; о злостных нарушителях паспортного режима, а именно о лицах, отказавшихся добровольно выехать из местности, проживание в которой им запрещено в связи с невыдачей паспорта или непропиской, и нарушивших данную ими подписку о выезде в указанный милицией срок, а также о лицах, самовольно возвратившихся в местность, в которой им было запрещено проживание.
При рассмотрении дел о нарушителях паспортного режима «тройки» обязывались проверять правильность и обоснованность лишения гражданина права проживания в данной режимной местности и целесообразность такого решения, а органы милиции обязывались обеспечить наличие в деле следующих данных: когда, кем и на каких основаниях нарушителю запрещалось проживать в данной режимной местности; кем и когда у привлеченного отобрана подписка о выезде из режимной зоны и объяснения привлеченного о причинах невыезда. Подписка привлеченного о выезде из режимной зоны обязательно приобщалась к делу.
При направлении на рассмотрение «тройки» дел о лицах, указанных выше, органы милиции должны были представить следующие материалы: постановление о задержании с указанием причины задержания; справку о судимости или о приводах; следственные материалы, т. е. протоколы допроса привлеченных, свидетелей и вещественные доказательства, если таковые имеются; в необходимых случаях — справки о состоянии здоровья; краткое заключительное постановление.
Рассмотрение каждого дела «тройкой» требовалось производить с обязательным вызовом на заседание «тройки» привлеченного. Если арестованный содержался вне краевого, областного центра, то перед отправкой дела на рассмотрение «тройки» арестованный допрашивался начальником горрайотдела (отделения) милиции совместно с прокурором, причем этот совместный допрос обязательно протоколировался, протокол приобщался к делу, а арестованный на «тройку» не вызывался.
По рассмотренным на «тройках» делам велся протокол, в котором указывались все собранные на рассматриваемое лицо материалы, краткое его объяснение, когда и за что задержан, где содержится под стражей и все новые данные, выявленные в процессе рассмотрения дела на заседании «тройки». В заключительной части протокола указывалось, кому какая административная мера предлагается и с какого числа считается начало ее срока. «Тройка» обязана была рассмотреть представленные ей дела не позже 15 дней после возникновения дела (арест, привод и т. п.). Решение «тройки» при отсутствии возражений прокурора приводились в исполнение немедленно, а протокол направлялся на утверждение Особого совещания НКВД.
При наличии разногласий приведение в исполнение решения «тройки» приостанавливалось и дело переносилось на рассмотрение Особого совещания НКВД.
Еще раз подчеркивалось, что арест уголовного и деклассированного элемента и нарушителей паспортного режима должен производиться повседневно, а не в порядке кампаний или путем массовых операций. При рассмотрении дел «тройки» должны тщательно и внимательно изучать все обстоятельства каждого дела и в точности руководствоваться Инструкцией ЦК ВКП(б) и СНК СССР от 8 мая 1933 г.244 С 29 июня 1938 г. из армии стали увольнять всех военнослужащих иностранного происхождения — поляков, немцев, финнов, эстонцев, латышей, греков и прочих.
На каждого увольняемого предлагалось подобрать компрометирующие данные и, если таковые были, то арестовывать их, ставя в известность 2-е управление НКВД.
Оформление следственных дел и их рассмотрение должно было производиться в соответствии с Приказом НКВД СССР №00485.