После убийства Царской Семьи доктор В. Н. Деревенко продолжал оставаться в городе, а затем активно помогал следствию: выезжал вместе с Судебным Следователем по важнейшим делам А. П. Намёткиным в район заброшенного рудника, участвовал в опознании многих обнаруженных там и в доме Ипатьева вещественных доказательств и пр.
С падением Перми, в декабре 1918 года, В. Н. Деревенко переезжает в этот губернский центр, где становится профессором теперь уже бывшего Императорского Пермского Университета. Незадолго до оставления столицы Прикамья войсками Верховного Правителя, доктор В. Н. Деревенко вместе со всем профессорско-преподавательским составом этого учебного учреждения эвакуируется в Томск, где продолжает свою работу в качестве Приват-доцента Томского Университета. (Проживая в Томске, он в сентябре 1919 года и был допрошен следователем Н. А. Соколовым.) Но, по мере отступления белых частей, фронт неуклонно приближается и к далёкому сибирскому Томску, который 22 декабря 1919 года вновь оказывается в руках большевиков.
До лета 1920 года бывший Почётный Лейб-Хирург В. Н. Деревенко работает на кафедре факультетской хирургической клиники. Наряду с этим, он также читает студентам медицинского факультета необязательный курс лекций по урологии, но уже в августе вместе с небольшой группой преподавателей «реэвакуируется в Пермь» для продолжения работы в стенах Пермского Университета.
В Перми Владимир Николаевич работает около трёх лет, после чего на короткое время уезжает в Петроград, где служит в различных армейских госпиталях. С 1923 года он уезжает в Екатеринослав, где последующие годы заведует кафедрой хирургических болезней в Днепропетровском (ранее Екатеринославском) Медицинском Институте.
Новое о биографии этого замечательного человека автору удалось узнать благодаря В. Ф. Гладышеву, известному Председателю общества «Пермский краевед», который в своей статье о В. Н. Деревенко приводит выдержку из газеты Днепропетровской Медицинской Академии, любезно переведённой на русский язык З. Никольниковой:
«Владимир Николаевич безукоризненно владел иностранными языками, систематически следил за мировой литературой и отлично знал её. Он был блестящим лектором, его лекции базировались на глубоких знаниях и умении ясно и четко, в образной форме преподнести тему, поэтому лекции профессора посещали не только студенты, но и практические врачи многих лечебных учреждений города.
Профессор В. Н. Деревенко был прекрасным клиницистом-диагностом. Диагностику он связывал с данными физиологии, патологической анатомии, другими дисциплинами. Разбор болезней, который он проводил, был исчерпывающий.
Особенно следует отметить высокую хирургическую технику Владимира Николаевича. Это был хирург-виртуоз, который свободно владел техникой сложных операций. Конечно, способствовало этому то, что В. Н. Деревенко получил основательную подготовку, прошёл прекрасную школу (у профессора С. П. Фёдорова). Так, Владимир Николаевич впервые в Днепропетровске стал применять инструментальные исследования и операции на мочевыводящих путях и т. д.
Итог его творческого научного пути – труд “Пособие по хирургии”, к сожалению, оставшийся в рукописи в связи с преждевременной смертью автора. Ранее В. Н. Деревенко опубликовал несколько своих научных работ, одна из которых – диссертация на звание доктора медицины “К вопросу об оперативном лечении невралгии тройничного нерва» (С.-Петербург, 1908)”». [588]