14 января 1945 года дивизия получила приказ на передислокацию. Ночными маршами через Мажейкяй, Седа, Тельшяй, Леплауке, Плунге дивизия вышла к Якубовасу на юго-востоке от Кретинги, чтобы участвовать в освобождении последней части литовской земли — Клайпеды. Полки шли маршем, поротно, солдаты несли на себе все снаряжение, проходя в сутки по 35–45 км.
С 15 по 17 января 1945 года дивизия доукомплектовывалась в районе Мажмала в 20 километрах северо-восточнее Вайнёде из числа полученного нового пополнения литовцев из 2-го отдельного Литовского запасного батальона в количестве 2081 человек
[342].С 19 января по 21 февраля 1945 года дивизия в составе войск 4-й ударной армии (командующий — генерал-лейтенант Малышев П.Ф. (1898–1972)) участвовала в Мемельской наступательной операции, в боях за Клайпеду.
Город был опоясан проволочными заграждениями, противотанковыми рвами, дотами, сплошными минными полями. В самой Клайпеде все каменные здания и подвалы были приспособлены к уличным боям. Сильный огонь вели с военных кораблей и из береговых укреплений.
К началу боев за Клайпеду Литовская дивизия была сосредоточена в районе Кретинги и составляла резерв командующего армией
[343]. К вечеру 26 января разведка боем установила отход противника во вторую и третью линию траншей. Командующий армией отдал приказ о наступлении по всему фронту с утра 27 января. Литовская дивизия была введена для наращивания удара в направлении северной части Клайпеды, левее 179-й дивизии. Воины дивизии шли в наступление под лозунгом: «Клайпеда была и останется литовским городом».Наступление развернулось по всему фронту, однако к 12 часам наши войска смогли овладеть только первой позицией главной полосы обороны противника.
В то же время 16-я дивизия на своем участке действовала энергично. Она вела наступление с рубежа Лаукжяме — Радайляй — Жёбряй в направлении Клайпеды.
Первые четыре километра по направлению к городу наступающие полки прошли в быстром темпе, с минимальными потерями.
Артиллерийским обстрелом с высоты на противоположном берегу реки Дане движение наступающих было остановлено. Противник отступил с этих позиций после того, как артиллеристы подавили его огневые точки, а рота 1-го батальона майора П. Белана под командованием лейтенанта Нарбутаса обошло высоту с юга.
Для наращивания темпов наступления командир дивизии ввел в бой 156-й полк.
Перейдя в наступление в 14 часов, 156-й и 249-й полки продвинулись на четыре километра. 156-й полк вел тяжелый бой за высоту на берегу р. Дана, с которой противник вел обстрел шоссе Клайпеда — Кретинга. Поскольку атака в лоб в 18.00 оказалась неудачной, 249-й полк вышел в тыл противника. Обходной маневр совершила рота 156-го полка лейтенанта Нарбутаса, которая атаковала высоту с тыла. Немцы начали отходить. В бою под Тауралауке Нарбутас получил смертельное ранение.
Когда наступление возобновилось в 18 часов, успеха сначала не было, и вновь командиры прибегли к обходному маневру — увидев, что два батальона 249-го полка зашли им в тыл и завязали там бой, оборонявшиеся в полосе наступления дивизии гитлеровцы отошли.
Одна за другой части дивизии ворвались в город и вышли на северные окраины Клайпеды.
Батальон майора Гладкова первым пробился в центр города в 2 часа 30 минут ночи 28 января. Майор связался со штабом полка по полевому телефону: какие будут указания? С командного пункта прозвучал приказ:
— Выйти к причалу, к морю.
Первым в порт Клайпеды в три часа ночи 28 января 1945 года пробился батальон М. Гладкова. В 5.30 утра 28 января батальон майора И. Баранова из 167-го полка вышел на берег Куршского залива
[344].В 8 утра 28 января город и порт Клайпеда были освобождены.
Город после боев и отхода немецких войск горел, взрывались одно за другим заминированные здания. При одном из этих взрывов погибла целиком одна из рот 167-го стрелкового полка.
В боях за освобождение порта соседом 16-й Литовской дивизии справа была 179-я Витебская стрелковая дивизия, входившая в 1941 году в состав 29-го Литовского стрелкового корпуса, и ее 234-му полку было присвоено наименование Клайпедского. Войсками 4-й ударной армии Клайпеда была полностью освобождена к 9 часам утра 28 января 1945 года.
Сразу же после освобождения Клайпеды решением командующего армией из нее были выведены бравшие город и порт вместе с 16-й дивизией 344-я и 70-я дивизии, во избежание излишних потерь от мин. Дивизия была единственным войсковым соединением, оставшимся в городе. Она вела разминирование силами своего инжнерного батальона, занимала оборону по восточному берегу залива Куришес — Хафф, приводила себя в порядок.
Уйдя из Клайпеды, немецкие войска переправились на узкую песчаную косу Курише-Нерунг, отделенную от берега заливом шириной до 2 км, покрытым тонким льдом. Прикрывая эвакуацию на кораблях и отступление по косе в Восточную Пруссию, они вели артиллерийский обстрел Клайпеды весь день 29 января.