Поначалу Морозов состав команды не менял, надеясь, что удастся заставить играть в полную силу игроков, полученных им в наследство от прежних тренеров. Однако ожидания не оправдались — футболисты, среди которых было мало коренных ленинградцев, не горели желанием биться за честь «колыбели революции», да и мастерства им не хватало. Поэтому накануне сезона 1980 года Морозов пригласил в команду воспитанников ленинградских футбольных школ, а также вернул тех игроков, которые ранее вынуждены были уйти из «Зенита». Вот они-то и составили костяк обновлённой команды. В 1980 году «Зенит» впервые занял третье место, однако следом последовал провал — видимо, молодые игроки слишком рано поверили в то, что уже достигли высот мастерства. В 1982 году команда заняла седьмое место, а по окончании сезона Юрию Морозову поступило предложение возглавить киевское «Динамо», что он и сделал.
Главным тренером «Зенита» был назначен Павел Садырин, ранее руководивший «дублем». Основа, заложенная Морозовым, и мастерство нового тренера дали результат — в 1983 году команда заняла четвёртое место, а в следующем, невиданное дело, завоевала звание чемпиона СССР, обойдя на финише «Спартак». И вот на что хотелось бы обратить внимание — из двадцати одного футболиста тогдашнего «Зенита» лишь трое не были воспитанниками ленинградского футбола. Чудеса! А ведь киевское «Динамо» собирало в свои ряды лучших игроков со всей Украины, да и московское «Динамо» с ЦСКА имели возможность мобилизовать в свой состав футболистов, достигших призывного возраста, из любых команд — от Владивостока и Магадана до Мурманска и Калининграда.
После победного сезона наступил спад — игроков «Зенита», не привыкших к подобным достижениям, постигла всем известная болезнь под названием «головокружение от успехов». В последующие два сезона команда не сумела подняться выше шестого места, что нанесло удар по моральному состоянию игроков — участились случаи нарушения спортивного режима, вдобавок возникло недовольство из-за распределения квартир и автомобилей. В 1987 году «Зенит» с трудом зацепился за четырнадцатое место в чемпионате. Сменился тренер, но в 1988 году — лишь шестое место, а затем последовал вылет в первую лигу. Судя по всему, команда не смогла удержаться в лидерах «на морозовских хлебах». Дальше было ещё хуже, и даже возвращение Юрия Морозова не помогло — в 1990 году команда заняла восемнадцатое место в первой лиге и в следующем сезоне должна была выступать уже во второй лиге. Ну кто же мог предположить, что чемпион страны за пять лет превратится в аутсайдера? В прежние времена «Зенит» могли спасти, расширив высшую лигу, но в годы «перестройки» и гласности такое решение было неприемлемо.
И всё же на помощь снова пришло партийное руководство. Конечно, организаторы ГКЧП ставили перед собой задачи, никак не связанные с футболом, хотя и в их рядах наверняка были футбольные болельщики. Но так уж получилось, что события августа 1991 года привели к развалу СССР — три «джина», вылезших из одной «бутылки» под названием КПСС, договорились об этом в Беловежской пуще. Большинство жителей страны не ждали от этого решения ничего хорошего, а вот «Зениту» повезло — чемпионат СССР приказал долго жить, динамовские команды Минска, Киева и Тбилиси стали чужаками, как и ташкентский «Пахтакор» с ереванским «Араратом». И вот «Зенит» вместо того, чтобы оказаться во второй лиге чемпионата СССР, получил право выступать в высшей лиге чемпионата России, впрочем, как оказалось, ненадолго.
Дело в том, что по мере ухудшения финансового положения страны нищали и футбольные команды — кому-то удалось найти поддержку в частных структурах, а вот руководство «Зенита» не сумело найти спонсора. Команду покинули опытные игроки, и она на три года обосновалась в первой лиге. Только после того, как появился благодетель в лице пивоваренной компании «Балтика», команда нашла в себе силы вернуться в высшую лигу.