21 марта 1918 г. все работы на Ковровском заводе были остановлены по финансовым и организационным причинам. Авансовые суммы израсходованы, снабжение остановлено, перспективы контрактов в связи с проводившейся «демобилизацией военных предприятий» неясны. В штате завода оставили только 60 человек. Весь 1918-й и начало 1919 года вместо запланированного производства завод занимался выживанием, по возможности — дооборудованием, набором кадров, а также — ремонтом оружия для Красной Армии. Федоров вынужденно занимает должности технического директора, директора-распорядителя, директора, главного инженера завода. Только в декабре 1918 г. Чрезвычайная комиссия по снабжению Красной Армии поставила вопрос об открытии Ковровского пулеметного завода и возобновлении контрактов на производство ружей-пулеметов системы Федорова и системы Мадсена. 17 декабря ГАУ предложило Федорову начать их производство полукустарным способом с привлечением квалифицированных слесарей, прежде всего к изготовлению лекал и инструмента, а не деталей оружия. 2 марта 1919 г. ГАУ предписывало Федорову: «Согласно постановлению Чрезвычайной Комиссии Вам надлежит принять все меры к скорейшему установлению на заводе производства ружей-пулеметов как Вашей системы, так и системы Мадсена. Кроме того, согласно указаниям Начальника ГАУ, Вам надлежит срочно пустить в работу 150 экз. ружей Вашей системы полукустарным способом». Федоров докладывает, что выполнение сразу двух заказов предоставляет для завода чрезвычайно трудную задачу, и просит определить очередность. Наконец, 22 июня 1919 г. (нового стиля) принято решение сосредоточить силы на производстве образца Федорова.
Изготовление первой пробной партии в 200 ружей-пулеметов Федорова начали во временном корпусе завода. Однако 10 июля во временном корпусе случился сильный пожар. Производство решили перенести в большой корпус, который еще достраивался.
В первых числах февраля 1920 г. одно ружье-пулемет Федорова доставили в Реввоенсовет Республики, где с ним ознакомился Главком С.С. Каменев. «Главком, ознакомившись с ружьем-пулеметом системы Федорова, — говорилось в телеграмме помощника начальника штаба Реввоенсовета Чрезвычайному уполномоченному по снабжению армии от 6 февраля 1920 г., — нашел его как с технический, так и с практической стороны крайне полезным, а посему просит принять все меры к поднятию производительности этих ружей на заводе с тем, чтобы 300 ружей-пулеметов было изготовлено в наикратчайший срок». К тому времени, правда, оружие получило новое название — «ружье-автомат» или просто «автомат» (применение этого названия к новому типу стрелкового оружия приписывают Н.М. Филатову). 14 октября 1920 г. уже М.В. Фрунзе просил у Каменева выслать автоматы для Южфронта. Но к 15 сентября 1920 г. были сданы только первые 15 (из них всего 8 снабжены запасными частями для отправки на фронт) и готовы комплекты для сборки 27–32 штук. До конца 1920 г. сдано только 100 автоматов. И только 21 апреля 1921 г. Совет военной промышленности признал, что массовое производство автоматов на Ковровском пулеметном заводе установлено.
Автоматы Федорова опоздали на Гражданскую войну, но применялись в ее так называемый «ликвидационный период» — на Кавказе и при подавлении Карельского восстания, поддержанного финскими интервентами. В январе — феврале 1922 г. успешный рейд по тылам финских интервентов в Южной Карелии совершил лыжный отряд Т. Антикайнена, составленный из курсантов Интернациональной военной школы и вооруженный автоматами Федорова, «трехлинейками» и шестью ручными пулеметами «Мадсен» (всего задействованный в операции батальон Интернациональной школы имел шесть пулеметов «Мадсен» и шесть «Шоша»). Как видим, автоматы использовали отдельные специально подготовленные «команды».
Ковровский завод все еще оставался в сложном положении. Он состоял из недавно достроенного главного производственного корпуса «А» и восстановленного после пожара временного деревянного корпуса «Б» (расшириться завод смог только к 1930 г.). С 1 октября 1922 г. по 1 октября 1923 г. на заводе изготовили 822 автомата, к концу 1923 г. число выпущенных автоматов достигло 1000.