Но подводные лодки были далеко не единственным противником малых охотников в первые два месяца войны. Охраняя конвои, неся дозоры, они 11 раз вступали в боевые схватки с вражескими канонерками, торпедными и сторожевыми катерами. Хотя, по мнению моряков, зенитно-артиллерийское вооружение МО-4 было недостаточно сильным, крупнокалиберные пулеметы и пушки «мошек» нередко оказывались единственной защитой конвоев от вражеских самолетов. За июнь — август 1941 года малые охотники уничтожили 23 вражеских самолета, причем МО-202 сбил четыре, а МО-402 и МО-413 — по три самолета. Зимой 1942 года пушки и пулеметы «мошек», вмерзших в лед, были включены в систему противовоздушной обороны Кронштадта.
В руках мужественных и умелых катерников даже сравнительно несильное зенитное вооружение делало чудеса. На Северном флоте малый охотник лейтенанта И. Кроля получил задание снять корректировочную группу. Когда катер подошел к берегу, на него налетели 18 вражеских «юнкерсов». Море вскипело от разрывов. Временами катер исчезал в фонтанах воды, но его пушки и пулеметы продолжали вести огонь. Несмотря на разбитое рулевое управление и вышедшие из строя два мотора, катер сбил два «юнкерса», отразил налет и своим ходом еле дошел до базы.
Еще более удивительный бой с воздушным противником провел в марте 1943 года черноморский сторожевой катер СКа-065. На рассвете 25 марта этот катер был обнаружен противником. А в полдень со всех направлений на СКа-065 устремились 17 вражеских бомбардировщиков. Сбив один самолет, малый охотник отбил первую атаку, за которой последовали вторая и третья… Более трех часов длился поединок катера с несколькими десятками вражеских бомбардировщиков. Когда СКа-065 с конвоируемым транспортом входил в Геленджикскую бухту, за ним тянулся длинный масляный след, сквозь пробоины свободно вливалась и выливалась вода, а сильно поредевший экипаж прилагал все усилия к спасению. Потом выяснилось, что в теле катера было около полутора тысяч пробоин, но восемь водонепроницаемых переборок спасли его от гибели.
Живучесть «мошек» была изумительной. В октябре 1941 года балтийский МО-311 подорвался на мине. Взрывом носовая часть была оторвана до самой рубки, треть команды погибла. И тем не менее катер остался на плаву, его электропроводка, рация и моторы были восстановлены силами экипажа. Задним ходом этот обрубок боевого корабля двигался к острову Гогланд и через два часа встретил тральщик, который снял экипаж. В другой раз вокруг охотника МО-123 разом взорвалось пять мин, полностью разрушивших корму и выведших из строя все моторы. И тем не менее катер остался на плаву и был другим охотником, МО-304, отбуксирован на базу.
Пожалуй, можно сказать, что для Советского Военно-Морского Флота «мошка» оказалась тем же самым, чем был для авиации По-2. Каждый раз, когда боевая обстановка ставила новую неожиданную задачу, мысль командования обращалась к малому морскому охотнику. Так, одним из фашистских сюрпризов в начале войны была донная неконтактная мина. Тралить их научились не сразу, а поскольку фарватеры надо было как-то расчищать и выводить корабли в море, к делу были приспособлены морские охотники. Они выходили на фарватер и сбрасывали серии глубинных бомб, взрывы которых вызывали детонацию зарядов донных мин. Позднее, в связи с острой нехваткой тральщиков на Балтике, малые охотники были приспособлены для траления обычных контактных мин. И это сделало их по-истине незаменимыми кораблями.
Летом 1942 года, когда в силу сложившихся условий подводные лодки стали главной ударной силой советского флота на Балтике, малые охотники наряду с другими легкими кораблями должны были эскортировать лодки до точки погружения у Шепелевского маяка. Фарватер, по которому проводились тогда лодки, простреливался полевой артиллерией противника, самолеты забрасывали его донными минами, катера и сторожевые корабли врага атаковали эскорты. Но малые охотники были поистине мастерами на все руки. Они закрывали лодку от артиллерийских наблюдателей дымовой завесой, отгоняли самолеты и корабли противника огнем своей артиллерии, бомбили донные мины глубинными бомбами и подсекали тралами обычные контактные мины.
Когда же, наоборот, понадобились минные заградители для постановки минных банок на выходе из финских шхер и в узлах внешних шхерных фарватеров, на помощь снова пришли малые охотники. Снабженные рельсами и минными скатами, они в первые месяцы войны с успехом выступили в роли минных заградителей и выставили в общей сложности 146 мин. Эти действия увенчались крупным успехом: в сентябре 1941 года на мине, поставленной малым охотником, подорвался и затонул финский броненосец береговой обороны «Ильмаринен», крепко досаждавший своим артогнем защитникам полуострова Ханко.