К удивлению и недовольству Римуса, семнадцатилетний Гарри не только отклонил его предложение, но даже разозлился и оскорбился. Он сказал своему бывшему учителю, что тот повел себя эгоистично и безответственно. Римус ответил с несвойственной ему грубостью и вылетел из дома, после чего нашел пристанище в «Дырявом котле», где сильно напивался.
Тем не менее, как следует все обдумав, Римус был вынужден признать, что бывший ученик преподал ему ценный урок. Римус подумал о Джеймсе и Лили, которые предпочли остаться с Гарри до конца, даже ценой собственной жизни. Его собственный родители, Лайелл и Хоуп, пожертвовали их миром и безопасностью, чтобы сохранить семью. Раскаявшись, Римус покинул гостиницу и вернулся к жене и попросил у нее прощения и поклялся, что, не смотря ни на какие обстоятельства, он никогда больше ее не оставит. Пока Тонкс была беременна, Римус избегал миссий в Ордене Феникса, поставив на первый план защиту своей жены и будущего ребенка.
Сын Люпина, Эдвард Римус («Тэдди»), был назван в честь недавно умершего свекра Римуса. К радости и облегчению обоих родителей, мальчик не проявил никаких признаков ликантропии после рождения, но от его матери ему передалась способность изменять свою внешность по собственному желанию. В ночь рождения Тедди, Римус ненадолго оставил Тонкс и своего сына на попечение свекрови, чтобы найти Гарри и поговорить с ним впервые после их ссоры. И тогда он попросил Гарри стать крестным отцом своему сыну, поскольку не чувствовал ничего, кроме благодарности к человеку, который вернул его в лоно семьи и тем самым подарил ему самое большое счастье.
Оставив своего маленького сына на попечение бабушки, Римус и Тонкс вернулись в Хогвартс на финальную битву с Волан-де-Мортом. Супруги знали, что если Волан-де-Морт выиграет эту битву, то они будут немедленно устранены, так как являются преданными членами Ордена Феникса. А по мнению Пожирательницы смерти Беллатрисы, тети Тонкс, Нимфадора и ее сын были полной противоположностью чистокровным, имея много родственников-маглов и даже каплю крови оборотня.
Пережив многочисленные сражения с Пожирателями смерти, вновь и вновь выходя сухим из воды, Римус Люпин встретил свою смерть от руки Антонина Долохова, одного из самых преданных и садистских последователей Волан-де-Морта. Римус уже не был в хорошем боевом состоянии, когда ринулся в битву. Месяцы без тренировок, используя только заклинания для защиты и сокрытия, не могли помочь ему победить мастера дуэлей — Антонина Долохова, который был прекрасно подготовлен, убивая и калеча людей на протяжении целых месяцев. Реакция Люпина оказалась слишком медленной.
Римуса Люпина наградили посмертно орденом Мерлина первой степени. Он был первым оборотнем, который удостоился этой чести. То, как он жил и то, как он погиб, сыграло важную роль для повышения авторитета оборотней. Он не был забыт. Все, кто его знал, говорил о нем как о храбром, добром человеке, который делал все, что мог, чтобы помочь в трудной ситуации, его помощь была намного более ценной, чем он сам это представлял.