Встреча с системой Юпитера официально закончилась 9 апреля. Единственной потерей на борту «Вояджера-1» стал фотополяриметр, отказавший 5 марта за шесть часов до пролета Юпитера. Высокоточную фотометрию, которая бы позволила получить данные о высоте облаков, форме и размерах частиц облачности, выполнить не удалось. При тестировании в конце ноября 1979 г. стало окончательно ясно, что трубка фотоумножителя почти полностью потеряла чувствительность. Прибор, переставший реагировать на свет, пришлось выключить.
Каковы же были итоги пролета с точки зрения баллистики? Максимальная скорость КА относительно Юпитера составила 28,7 км/с и снизилась при удалении от планеты до 11,6 км/с. Гелиоцентрическая скорость на подлете была 13,1 км/с, она достигла максимума в 37,1 км/с через 1 ч 45 мин после перииовия и к середине апреля уменьшилась до 23,5 км/с. Таким образом, «Вояджер-1» «выиграл» от встречи с Юпитером более 10 км/с, не считая «бесплатного» разворота в сторону новой цели! И именно после Юпитера его орбита вокруг Солнца из эллиптической превратилась в гиперболическую.
Коррекцию траектории TCM-A5, нацелившую аппарат на Сатурн, провели не на 70-й день после Юпитера, как планировали на Земле, и не на 11-й, как решили было осенью 1977 г., а на 35-й – 9 апреля. Это был самый серьезный маневр за всю историю полета – двигатели проработали 7,3 часа, чтобы придать «Вояджеру» приращение скорости 64 м/с, и израсходовали 30 кг топлива; в баке осталось еще 55 кг на весь оставшийся путь. С 13 апреля 1979 г. «Вояджер-1» перешел в режим перелета с регулярными измерениями параметров межпланетной среды.