В марте 1967 года он был произведён в прапорщики (Warrant Officer
), а в апреле получил назначение на главную военно-морскую базу США в Норфолке (Norfolk), штат Вирджиния, дежурным офицером связи (communications watch officer) штаба командующего Военно-морскими подводными силами США в Атлантике (COMSUBLANT), который одновременно является командующим Объединённым подводным флотом НАТО. Уокер оказался в самом центре связи подводного флота, через него проходила вся переписка командования с подводными силами стратегического назначения, включая их местонахождение, боевое задание, степень готовности. Он был в курсе всех оперативных планов и боевых приказов командования.Это означало, что советская разведка впервые за многие годы поймала настоящую «золотую рыбку». О такой удаче никто и не мечтал. К тому же 23 января 1968 года у берегов Северной Кореи был захвачен американский корабль радиоэлектронной разведки USS Pueblo
, который занимался радио- и радиотехнической разведкой и выявлением средств радиоэлектронной борьбы кораблей ВМФ СССР, находящихся в районе Цусимского пролива. Когда USS Pueblo приблизился к северокорейским территориальным водам, к нему подошёл северокорейский противолодочный корабль и потребовал обозначить свою государственную принадлежность. Команда USS Pueblo подняла американский флаг и попыталась выдать себя за гражданское океанографическое судно. Северокорейские моряки сделали несколько предупредительных выстрелов, на горизонте показались торпедные катера, а в небе — два истребителя МиГ‑21, после чего северокопейские военные поднялись на борт USS Pueblo и отвели его в порт Вонсан, а американцев с поднятыми руками и завязанными глазами доставили на берег и поместили в лагерь для военнопленных.В журнале Naval History Magazine
за июнь 2010 года утверждается, что захват USS Pueblo был осуществлён специально, чтобы КГБ могло получить находящиеся на борту шифровальные машины двух типов: KL-7 ADONIS и KW-7 ORESTES. Первая из них была создана АНБ на основе немецкой шифровальной машины «Энигма» как стандартное криптографическое устройство для всех видов вооружённых сил США.Гораздо более сложной и защищённой системой был новейший криптотелетайп KW-7 ORESTES
, которым в 1968 году оснастили все американские атомные подводные лодки. Его применение фактически исключало фигуру шифровальщика. Подготовленное сообщение подавалось с самого обычного телетайпа прямо на KW-7, а с него на радиопередатчик, работающий в диапазоне средних волн. Для ввода кода KW-7 имел специальную цифровую коммуникационную панель, позволявшую вручную водить комбинацию цифр со страницы шифровального блокнота или кодовой книги.Несмотря на потерю установленного на USS Pueblo
оборудования, руководство АНБ исходило из того, что противнику не достались шифровальные блокноты. А без них, как было доложено президенту Джонсону, проникнуть в радиообмен американских морских ядерных сил с береговыми штабами было невозможно, так как сами ключи к шифрам менялись ежесуточно. Но советская разведка уже регулярно получала их от Джона Уокера.Работа с ним была настолько засекречена, что к ней не было допущено ни одно оперативное подразделение внешней разведки. По распоряжению Председателя КГБ Юрия Владимировича Андропова в ПГУ (внешняя разведка) на базе спецгруппы ТФП
(тайное физическое проникновение) был создан 16‑й отдел (радиоэлектронная разведка), начальником которого был назначен генерал-майор Андрей Васильевич Красавин — опытнейший чекист, участник Великой Отечественной войны, с 1941 года оперуполномоченный, старший оперуполномоченный и начальник отдела УНКВД-УНКГБ СССР по Ленинградской области, который с 1946 года работал резидентом внешней разведки в Австрии, а с 1955 года — во Франции.В 16‑м отделе с помощью полученных от Уокера схем шифровальных машин при участии ведущих советских учёных-криптографов и криптоаналитиков были воспроизведены все использующиеся в США криптографические устройства. За 17 лет с помощью «кода Уокера», как считают американцы, в Советском Союзе имели возможность прочитать более миллиона зашифрованных сообщений военно-морского флота США. Это позволило уже в конце 1960‑х годов отслеживать оперативные планы американской армии во Вьетнаме и резко повысить эффективность применения советских ЗРК С-75
против стратегических бомбардировщиков В-52.